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l第章药物设计的基本原理和方法
* 第五节定量构效关系方法简介 (Quantitative Structure –Activity Relationships) 定量构效关系(Quantitative Structure –Activity Relationships,QSAR): 1868年,有人提出药物的生物活性与化合物的结构特征呈函数关系 : 是一种新药设计的研究方法,可以作为先导化合物优化的一种手段。也是计算机辅助药物设计的一个重要内容 A=f(C) 生物活性 化合物的结构特征 由于学科的限制,并没有成功地将此关系用于药物设计 Evaluation only. Created with Aspose.Slides for .NET 3.5 Client Profile 5.2.0.0. Copyright 2004-2011 Aspose Pty Ltd. 20世纪 60年代 发展建立了三种定量构效关系的研究方法 使定量构效关系研究变为可能,并在药物设计中发挥重要作用 定量构效关系: 并根据信息进一步 是指选择一定的数学模式 ,应用药物分子的物理化学参数、 结构参数 和拓扑参数 及生物活性, 对药物分子的化学结构 与其生物活性间关系进行定量分析, 找出结构与活性间的 量变规律, 或得到构效关系的数学方程, 对药物的化学结构进行优化。 Evaluation only. Created with Aspose.Slides for .NET 3.5 Client Profile 5.2.0.0. Copyright 2004-2011 Aspose Pty Ltd. 分三种方法: 第一种方法: Hannsch分析法,1964年由美国Hansch和日本藤田建立 该法的特点是以热力学为基础,应用化合物的疏水性参数、电性参数和立体参数表达药物的结构特征,分析结构与生物活性的构效关系。 第二种方法 Free-Wilson法 用数学加和模型表达药物的结构特征,分析其定量构效关系 第三种方法 Kier分子连接性法 根据拓扑学原理将分子连接性指数作为化合物结构的参数 结构参数的物理意义明确,便于研究构效关系,设计并预测化合物的活性,应用最为广泛 Evaluation only. Created with Aspose.Slides for .NET 3.5 Client Profile 5.2.0.0. Copyright 2004-2011 Aspose Pty Ltd. Hansch方法认为,药物能呈现生物活性,是药物小分子与生物大分子相互作用的结果,这种相互作用,与药物的各种热力学性质有关,而且这些热力学性质具有加和性,Hansch分析法又称线性自由能相关模型。 Hansch方程的基本通式是: Log 1/C = ?a?2 + b? + c? + dEs + ··· +k Log l/C = ?a logP2 + blogP + c? + dEs + ··· +k 上述参数除电性参数外,大多数有加和性,便于计算 化合物的生物活性参数 化合物的结构特性参数 结构的疏水多数 结构的电性参数 结构立体特征参数 Evaluation only. Created with Aspose.Slides for .NET 3.5 Client Profile 5.2.0.0. Copyright 2004-2011 Aspose Pty Ltd. Hansch方程有时还使用I作为指示变量,I是一种半定量的参数,只有1和0两个值。 I用来描述不能用连续变量表达的药物分子特征 一、疏水性参数(Lipophilicity Parameters) 分子疏水性参数IogP,即分子的脂水分配系数(partition coefficient),表示分子的疏水性 化合物在有机相和水相中分配平衡时的量(摩尔)浓度Co和CW之比值,P=CO/CW P值一般较大,常用IogP表示 当分子中有该取代基时I为1,当分子中没有该取代基时I为0。 Evaluation only. Created with Aspose.Slides for .NET 3.5 Client Profile 5.2.0.0. Copyright 2004-2011 Aspose Pty Ltd. logP的测定: 用经典的摇瓶法测定,为最准确的数据 logP还能用HPLC的方法 对一些已知此合物,可以从Hansch的数据手册或计算机辅助药物设计工作站的数据库查到logP的有关数据。 目前最快速的方法是在计算机工作站上建构化合物的二维结构,通过分子动力学计算优化,得到三维优势构象,用CLOGP商业软件模块计算,可自动得到logP的数据 研究对象是同源化合物时,由于具有相同的基本母核,可用取代基
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