第11章 基因组的进化[精选].pptVIP

第十一章 基因组的进化 第一节 基因组进化的分子基础 第二节 基因组进化的模式 * * 第一节 基因组进化的分子基础 1.突变 1.1突变的机制 自发的错误(spontaneous error)，在复制过程中这些突变逃脱了DNA聚合酶的校正而保留在新合成的子链中。但在下一轮DNA复制时，子代链与祖代链在错配的位置将发生碱基代换。 来自亲代DNA分子的某一单链，在复制时以这条已发生碱基改变的单链作为模板合成新链。由此产生的子代DNA中，会将这一变异一直保留下去。 第一节 基因组进化的分子基础 1.突变 1.1突变的效应 突变对基因组的影响 同义突变 错义突变 终止突变 连读突变 移码突变 突变对多细胞生物的影响 功能丧失突变（loss-of-function mutation）：通常是一个减弱或消除蛋白质活性的突变造成的结果。多数功能丧失突变是隐性性状。 功能获得性突变（gain-of-function mutation）：这类突变不常见，突变必须提供一种异常的蛋白质活性。 第一节 基因组进化的分子基础 2.重组 2.1同源重组——Holliday模型 Holliday模型描述的重组发生在2个同源双链分子之间，也包括彼此间只有小段区域同源的分子或同一分子中2个同源区段之间的重组。 在一条单链产生缺口 单链侵入 D环 形成异源双链 同源重组的起始（Meselson Radding模型） 2条同源DNA分子 A B a b DNA分子间单链交换组成异源双链 DNA连接酶 A B a b Holliday结构 分叉迁移 A B a b A B a b 形成叉口(chi) 垂直分割 相互交换 水平分割 同源重组的Holliday模型 第一节 基因组进化的分子基础 AB ab Ab aB 第一节 基因组进化的分子基础 2.重组 2.2位点专一性重组 区段之间存在广泛的同源性并非重组的必要前提，在2个DNA分子之间有时只有很短的共同序列也能起始重组过程，这类重组称为位点专一性重组(site-specific recombination)。 2.3双链断裂重组模型 基因转换(gene conversion)的DNA双链断裂重组模型。 3.转座 3.1DNA转座 3.2逆转录转座 第二节 基因组的进化模式 λDNA POP’ BOB’ att位点 细菌DNA BOP’ POB’ λ噬菌体基因组整合到大肠杆菌染色体DNA中 λ噬菌体基因组和大肠杆菌基因组各有一个att位点，每个都有一个称为O的相同的中间顺序和两侧顺序组成。 大肠杆菌O两侧序列为B和B’（表示bacterial att site)，噬菌体O两侧序列为P和P’（表示phage att site）。 第一节 基因组进化的分子基础 哺乳动物DNA双链断裂重组模型 此机制中合成的DNA都是以同源分子区段作为模板从断裂处开始拷贝，这是基因转换的分子基础。因为由外切核酸酶从缺口处开始切除的单链顺序现在由未切割的同源分子单链所取代。酵母中交配型的基因转换具有类似的机制。 RPA RAD50 MRE11 NBS1 RAD52 RAD54 RAD51 1.同源搜寻 2.单链侵入 3.DNA合成 DNA连接酶 解离酶 同源重组 第二节 基因组进化的模式 1.遗传系统的起源 1.1RNA世界 由于具有催化活性RNA的发现，关于生命系统起源的研究才发生了根本性的改变。称为核酶的RNA包括rRNA和tRNA可以完成多种生化反应：(1)自我剪接，三种内含子的加工能力；(2)催化切断其他RNA，如mRNA和rRNA的加工中切除内含子；(3)合成多肽键，这是rRNA分子的重要功能之一；(4)催化核苷酸的合成。 RNA催化活性的发现解决了以往关于先有多聚核苷酸还是先有多肽链的两难困境，表明最初的生化系统整个地集中在RNA。 第二节 基因组进化的模式 1.遗传系统的起源 1.1RNA世界 初始RNA分子 新互补拷贝 自发多聚体化 初始模板 核苷酸 早期RNA世界RNA分子的拷贝 在RNA多聚酶进化之前，与RNA模板结合的核糖核酸能自发地聚合。这一过程很不精确，但可产生许多RNA序列。 第二节 基因组进化的模式 1.遗传系统的起源 1.2基因组的起源 编码RNA分子转变为第一个DNA分子 第一个拷贝的DNA分子 核苷酸 脱氧核糖核苷酸 T A C T 还原 dA dC dG G T A C