生化分子生物学考研笔记..doc

生物化学分子生物学 复习经典笔记 1上个世纪的三个计划：曼哈顿、阿波罗、人体基因工程：人类23对染色体（23对DNA分子）测序，几十万个基因，大肠杆菌8000个基因，基因改造（治病），WATSON和CRICK。诺贝尔奖金（90多万美元，最高荣誉）的分布：化学，医学，生理学领域不说独占鳌头也是多抢多占，如蛋白质的螺旋和折迭（化学）、G蛋白、第二信使学说的三代科学家三次获奖，光合作用机制，更不要说核酸领域了（复制、转录、逆转录、RNA复制等中心法则中的内容）。今天的考研是为了明天的诺贝尔奖！ 　　 对映体：一个不对称碳原子的取代基在空间里的两种取向是物体与镜像的关系，并且两者不能重叠。这两种旋光异构体称为对映体。两个对映体具有程度相同但方向相反的旋光性（D+与L-;D-与L+）和不同的生物活性，其他物理和化学性质完全相同。含n个C*的化合物，其旋光异构体的数目是2n, 组成2n /2对对映体。任一旋光化合物都只有一个对映体，它的其他旋光异构体在理、化性质都与之不同，不是对映体的旋光异构体称非对映体。仅一个手性碳构型不同的非对映体称差向异构体（有几种情况）。 异头物：单糖由直链结构变成环状结构后，羰基碳成为新的手性碳（异头碳），导致C1差向异构化，产生两个非对映体，称之。α、β异头物判断：有2种方式。见P9-10。 　　多不饱和脂肪酸家族：分为ω-3和ω-6系列（指离羧基最远的双键到甲基末端3个碳和6个碳）。如亚油酸和γ-亚麻酸为ω-6系列，而α-亚麻酸为ω-3系列。人体内二者不能互转！且二者对血脂的影响不同。 　　皂化值：皂化1g油脂所需的KOHmg数； 　　碘值：100g油脂卤化时所吸收的碘的克数； 　　乙酰值：中和1g乙酰化物所释放的乙酸所需要的KOHmg数； 　　酸值：中和1g油脂中的游离脂肪酸所需的KOHmg数。 　　氨基酸洗脱顺序的判定：氨基酸与树脂的亲合力主要决定于它们之间的静电吸引，其次是氨基酸侧链与树脂聚苯乙烯之间的疏水相互作用；亲和力愈大愈难洗脱！ 　　肽的理化性质： ①肽键的酰氨氢不解离，肽的酸碱性质主要决定于肽键中的游离末端α-NH2、α-COOH及侧链R基上的可解离基团； ②肽中末端α-羧基的pKa值比游离氨基酸的大，末端α-氨基的pKa值比游离氨基酸的小； ③游离的α-氨基、α-羧基和R基可发生与氨基酸中相应的类似反应，如茚三酮反应等； ④蛋白质部分水解后所得的肽若不发生消旋，则有旋光性，短肽的 旋光度约等于组成氨基酸的旋光度之和，较长的肽的旋光度则不是简单加和。 　　α角蛋白经充分伸展后可转变成β角蛋白，即β折叠片结构。 　　蛋白质纯度的鉴定方法：采用物理化学方法如电泳、离心沉降、HPLC和溶解度分析等。纯的蛋白质电泳时，其电泳图谱只呈现一个条带或峰，离心时以单一的沉降速度移动；纯的蛋白质在一定的溶剂系统中具有恒定的溶解度，即溶解度曲线只有一个折点，在折点以前直线斜率为1，在折点以后斜率为零；此外，N-末端分析也用于纯度鉴定（单体蛋白质而言）。必须指出，采用任何单独的一种方法鉴定纯度只能作为蛋白质均一性的必要条件而非充分条件，即蛋白质往往在一种鉴定中表现为均一性，而在另一种鉴定中又表现为不均一性。 　　酶活性部位的研究方法：酶分子侧链基团的化学修饰法（巯基、氨基、羧基、羟基、咪唑基、胍基等）；X射线晶体结构分析法；定点诱变法（改变编码蛋白质基因中的DNA顺序来研究酶活性部位必需氨基酸的变化）等。 　　关于别构酶： ①别构酶的酶促反应大多不符合Michaelis-Menten动力学，即不符合米氏方程，其酶促反应曲线为S型（正协同）或双曲； ②效应物（别构剂）与调节亚基（调节部位）结合后导致酶构象的改变，引起酶催化部位的活性增加或降低； ③具活性中心和别构中心，且二中心处在酶蛋白的不同亚基或同一亚基的不同部位，即调节部位不同于催化部位； ④许多别构酶常处于代谢途径的起始部位或受控部位，代谢途径的终产物常作为别构酶的负效应物抑制这些酶； ⑤所有的别构酶均为寡聚酶； ⑥存在同促效应和异促效应：底物分子本身对别构酶的调节作用称同促效应；非底物分子对别构酶的调节作用称异促效应； 　　补充：为了区分符合米氏方程的酶和正协同效应的别构酶及负协同效应的别构酶，Koshland建议用协同指数（cooperativity index，CI）来鉴别不同的协同作用以及协同的程度。CI是指酶分子中的结合位点被底物饱和90%和饱和10%时底物浓度的比值。故协同指数又称饱和比值(Rs)。CI=Rs=81 1/n，n为协同系数（Hill系数），存在下列不同的Rs值： 典型的米氏方程酶：Rs=81； 正协同效应的别构酶：Rs＜81，且Rs愈小，正协同效应愈显著； 负协同效应的别构酶：Rs＞81,且Rs愈大，负协同效应愈显著