蛋白质化学3课件.pptVIP

6 蛋白质的分子结构 多肽链的氨基酸序列决定了蛋白质的高级结构，决定了 蛋白质的生物学功能。 组成蛋白质的22种氨基酸，侧链基团的理化性质和空间排布各不相同，当它们按照不同的序列关系组合时，形成多种多样空间结构和生物学活性的蛋白质分子。 蛋白质的结构分为： 一级结构、二级结构、三级结构、四级结构。 在二、三级结构间划分出超二级结构和结构域。 6.1 蛋白质的一级结构 蛋白质的一级结构是指蛋白质中氨基酸的排列顺序。 1953年英国Sanger等人，完成了牛胰岛素(Isulin)一级结构测定工作，分子量为5700D，有A链(21AA)和B链(30AA)两条肽链，两个链间有二硫键和一个链内二硫键(A链)。 1960年Stanford Moore等完成了牛胰核糖核酸酶(RNase)的分析。 RNase由一条含124个氨基酸残基的多肽链组成， 分子内含有4个链内二硫键，分子量为12600。 RNase是水解核糖核酸磷酸二酯键的酶。 6.2.1 多肽链折叠的空间限制 ⑴肽平面(peptide plane) 肽键 形式上是单键, 具有部分双键的性质，因而不能旋转。 肽键的C及N周围三个键角之和均为360°，使肽键的四个原子和与之相连的两个?碳原子(C?)都处在同一个刚性平面－肽平面。 肽链中只有α碳原子形成的单键能够旋转，决定两个肽键平面的位置关系。 肽键平面成为肽链盘曲折叠的基本单位。 6.2.2 二级结构的基本类型 ⑴?-螺旋结构（?-helix） 1950年Pauling和Corey对α-角蛋白(α-keratin)进行X线衍射分析，从衍射图中看到有0.5～0.55nm的重复单位，故推测蛋白质分子中有重复性结构，认为这种重复性结构为α-螺旋。 天然蛋白质绝大多数为右手?-螺旋。 ①多个肽平面通过α-碳 原子旋转，相互紧密盘曲成规则的周期性构象，即右手螺旋。 ②主链呈螺旋上升，每3.6个氨基酸残基上升一圈，螺距0.54nm，每个Aa残基沿轴上升0.15nm。 影响α-螺旋形成的因素： 酸性或碱性氨基酸集中的区域，同电荷相斥; 较大的R(如Phe、Trp、Ile)集中的区域; Pro 亚氨基酸,不易形成氢键; Cα位于五元环上,不易扭转; Gly R基为H，空间占位很小，也会影响该处螺旋的稳定。 ⑵ ??折叠结构（?? pleated） Astbury等人曾对β-角蛋白进行X线衍射分析，发现具有0.7nm的重复单位。 如将毛发α-角蛋白在湿热条件下拉伸，可拉长到原长二倍，这种α-螺旋的X线衍射图可改变为与β-角蛋白类似的衍射图。说明β-角蛋白中的结构和α-螺旋拉长伸展后结构相同。 ??折叠也称β-片层（??pleated sheet） ??conformation)是由两条或多条几乎完全伸展的多肽链侧向通过氢键连接在一起，相邻两肽链以相同或相反方向平行排列成片状。 ①肽链处于相当伸展的结构，肽链平面之间折叠成锯齿状，相邻肽键平面间呈110°角。每个Aa残基伸展的长度为0.35，AA残基的R侧链伸出在锯齿的上方或下方。 ②依靠两条肽链或一条肽链内的两段肽链间的C=O与另一条的-NH基之间形成氢键，使构象稳定。 ③两段肽链可以是平行的或是反平行的。 ④平行的β-片层结构中，重复距离为0.65nm；反平行的β-片层结构，则间距为0.7nm。 ⑶ ?? 转角（ ??turn） 也称??弯曲(??bend)、回折(reverse turn)。是指 肽链出现180o回折，由弯曲处的第一个AA残基的 -C=O与第四个AA残基 -NH间形成氢键(4?1氢键) 产生一种不很稳定的环形结构。 X－NH ：O＝C(X＋3) ⑷无规卷曲 没有确定规律性的部分肽链构象，肽链中肽键平面不规则排列,属于松散的无规卷曲(random coil). 6.2.3 超二级结构和结构域 超二级结构和结构域都是蛋白质构象中二级结构与三级结构之间的一个层次。 ⑴超二级结构(super-secondary structure) 超二级结构是多肽链内顺序上相互邻近的若干二级结构单元常在空间折叠中靠近，相互作用形成规则的结构组合体(combination) ，充当三级结构的构件。 ?? 由二段或三段右手?-螺旋彼此缠绕而成的左手 超螺旋(superhelix)，存在于?-角蛋白、肌球 蛋白和纤维蛋白中。 ??? 由两段或三段平行??折叠链（单股链）和一段连结链组成，连结链为?-螺旋或无规则卷曲。 最常见的??? 组合是由三段平行式的??折叠链和二段?-螺旋链构成，称为Rossmann折叠。 ???是由几