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DNA结构双螺旋结构的提出,被认为是本世纪生命科学史最重要的贡献之一,同时也是自然科学史上的重大贡献。它直接解释了生物遗传信息的传递与表达的规律,使生命科学从此进入一个崭新的时代即分子生物学时代。 2、DNA双螺旋结构的稳定因素 碱基堆积力 链间氢键 疏水作用 其它次级键:离子键,范德华力 (三) DNA二级结构的多态性 所谓DNA二级结构的多态性,是指DNA不仅具有多种形式的双螺旋结构,而且还能形成三链、四链结构,说明DNA的结构是动态的,而不是静态的。核酸的构型的多样性是由于核酸主干链上各键和碱基的旋转造成的,而多链的DNA是特定的碱基序列导致的结果。 1. DNA双螺旋的不同构型 B-DNA螺旋:标准的?Watson, Crick双螺旋,细胞 正常状态下DNA存在的构型。 (2) A-DNA螺旋:DNA在75%相对湿度的钠盐中的构型。 (3) C-DNA螺旋:DNA在66%相对湿度的锂盐中的构型。 (4) Z-DNA螺旋:左手的DNA螺旋,这种螺旋可能在基 因表达或遗传重组中起作用。 4.56 3.4 (3.57)* 2.53 螺距 1.8 12 0.38 左手 Z-DNA 2.0 10 (10.5)* 0.34 右手 B-DNA 2.55 11 0.23 右手 A-DNA 螺旋直径 (nm) 碱基数/圈 碱基升高 (bp) 螺旋方向 ⒉ 与DNA碱基顺序相关的特殊二级结构 (1) 回文序列 所谓回文序列就是指DNA某一片段旋转180° 后,顺序不变的序列,回文序列中的单链可形成发夹结构。双链可形成十字架结构。这种发夹结构或十字架结构在大肠杆菌细胞DNA中已有发现. * * 第二章 核酸 §2.2 核酸的化学组成 一、元素组成 组成核酸的元素有C、H、O、N、P等,与蛋白质比较,其组成上有两个特点:一是核酸一般不含元素S,二是核酸中P元素的含量较多并且恒定,约占 9~11%。因此,核酸定量测定的经典方法,是以测定P含量来代表核酸量。 二、核酸的化学组成和命名 (一)核酸的水解 核酸经水解可得到很多核苷酸,因此核苷酸是核酸的基本单位。 水解 核酸就是由很多单核苷酸聚合形成的多聚核苷酸; 核苷酸可被水解产生核苷和磷酸; 核苷还可再进一步水解,产生戊糖和含氮碱基。 (二) 核酸水解产物的结构 (1) 核苷酸中的碱基均为含氮杂环化合物, 它们分别属于嘌呤衍生物和嘧啶衍生物。 核苷酸中的嘌呤碱基(purine)主要是: 鸟嘌呤(guanine, G) 腺嘌呤(adenine, A) 嘧啶碱基(pyrimidine)主要是: 胞嘧啶(cytosine, C) 尿嘧啶(uracil, U) 胸腺嘧啶(thymine,T)。 碱基的结构式如下图所示 : (嘌呤) (嘧啶) (嘌呤) (嘧啶) (2) 核酸中五种碱基中的酮基和氨基,均位于碱基环中氮原子的邻位,可以发生酮式-烯醇式或氨基-亚氨基之间的结构互变。这种互变异构在基因的突变和生物的进化中具有重要作用。 尿嘧啶 胞嘧啶 有些核酸中还含有修饰碱基(modified component)或稀有碱基(unusual component),这些碱基大多是在上述嘌呤或嘧啶碱的不同部位被甲基化 (methyla-tion) 或进行其它的化学修饰而形成的衍生物。一般这些碱基在核酸中的含量稀少,在各种类型核酸中的分布也不均一。DNA中的修饰碱基主要见于噬菌体DNA,如5-甲基胞嘧啶 (m5C),5-羟甲基胞嘧啶 hm5C;RNA中以tRNA含修饰碱基最多,如1-甲基腺嘌呤 (m1A),2, 2-二甲基鸟嘌呤 (m22G) 和5, 6-二氢尿嘧啶 (DHU) 等。 (3) 嘌呤和嘧啶环中含有共轭双键,对260 nm左右波长的紫外光有较强的吸收。碱基的这一特性常被用来对碱基、核苷、核苷酸和核酸进行定性和定量分析. 2、戊糖 核酸中的戊糖有核糖 (ribose) 和脱氧核糖 (deoxyribose) 两种,分别存在于核糖核苷酸和脱氧核糖核苷酸中。为了与碱基标号相区别,通常将戊糖的C原子编号都加上“ ′”,如C1′表示糖的第一位碳原子。核糖的结构如下: 3、核苷 戊糖与嘧啶或嘌呤碱以糖苷键连接就称为核苷,通常是戊糖的C1′与嘧啶碱的N1或嘌呤碱的N9相连接。 (三)核苷酸及其衍生物的结构 核苷酸由无机磷酸、戊糖和含氮碱基三部分。 1、核苷酸的结构式 2、脱氧核苷酸的结构式 ADP、ATP是生物体中重要的能量转换体。 ddNTP在DNA的序列测定中使用。 3、(脱氧)核苷二磷酸、(脱氧)核苷三磷
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