第十三章基因组学.pptVIP

* * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * ☆单核苷酸多态性是指基因组ＤＮＡ序列中由于单个核苷酸(Ａ,Ｔ,Ｃ,Ｇ)的替换而引起的多态性。通常SNPs不包括碱基的插入、缺失以及重复序列拷贝数的变化。这种标记只有两种等位基因。 人类基因组的编码基因中有20万个SNPs, 在非编码区的数目可能还要多10倍以上。 ☆单倍型：当前常用术语“happlotype”(单倍型)代替术语“allele”(等位基因)。在给定的一条染色体的紧密连锁的位点上多个等位基因的集合,通常3～4个相邻等位基因彼此靠近而构成的单倍型可作为一个整体而遗传(称为单倍型块(haploblock) SNP ( single nucleotide polymorphism ) 特性 RFLP RAPD SSR ISSR AFLP 分布 普遍存在 普遍存在 普遍存在 普遍存在 普遍存在 遗传 共显性 多数显性 共显性 多数显性 多数显性 多态性 中 高 高 高 非常高 等位检测 是 不是 是 不是 不是 检测位点数 1~3 1~10 1~5 0~50~更多 20~100 样品信息量 低~中 高 高 高 非常高 基因组区域 底拷贝编码 整个基因组 整个基因组 整个基因组 整个基因组 技术难度 中等 简单 简单 简单 中等 重