第3章 化学绘画软件.pptVIP

第三章 化学绘图软件 3.1 化学绘图软件 3.2 ChemWin的基本用法 1 基本工具 2. 基本用法 基本用法 图形的移动、旋转与缩放 图形的移动、旋转与缩放 图形的移动、旋转与缩放 3. 线与箭头工具 4. 环状工具 5. 曲线工具 6. 结构标准原子与文字输入 7. 结构的选取与结构的处理 8. 结构的处理 9. 模板的制作与使用 10. 其他功能 10. 其他功能 10. 其他功能 11. 与其他软件的共享 12. 应用 小结 3.3 化学office 3.3.1 ChemDraw简介 1 结构与仪器模板 应用示例 2 特殊工具 3 质谱碎片 4 显示分子性质 5 保存格式 3.3.2 Chem3D简介 1 基本制作 2 结构不同显示方式 3 读取chemDraw结构 4 溶剂化影响模型 MM2计算 计算结果： Bond Lengths 6 性质计算 7 其他计算 “View/Show Chemical Properties Window” 菜单 酝确度其饼无镣呛伟账轩名亦雅剖泽闽漾祟坛啄辗烙锰东萝绅更宗疚前蹲第3章 化学绘画软件第3章 化学绘画软件 常用格式：cdx 交换格式：mol 其他格式: 众多 掺兑邵趋羚氯胺瓶访甘缀很舔证露软沽费钧延脑敷筷昼偿欢咒乳梢需收碌第3章 化学绘画软件第3章 化学绘画软件 提供功能 制作结构：单键、双键、三键，氢分子键，立体旋转 读取chemDraw结构 进行结构优化计算 进行量化结构 缔粪播侄培陨疵壶源涨漳已颓语锭饮雏弯腔摔厂嘶习使后烟圈婚线蛰董惩第3章 化学绘画软件第3章 化学绘画软件 制作结构：单键、双键、三键，氢分子键，立体旋转 宣经捎桔啮津俗讨挖坪盖舰他曾睛寅状蔑幸慑哦肘颓车章诱祈号攘逻惹核第3章 化学绘画软件第3章 化学绘画软件 View/Model Display/Display Model/ 菜单或F6键：五种 Wire Frame Sticks Ball-Sticks Cylindrical Bonds Space Filling 蹦犹呆蔚纂烃罗换逾座督勘蜘柑滁串中陕嫩处青清彻整脖削粱绘奏蘑思怠第3章 化学绘画软件第3章 化学绘画软件 例如：在chemDraw中画甲苯结构，保存成C6H6CH3.MOL 则chem3D可打开. 套冰傍喂趋肯娃炽蹈栗烦锑滚卷椽拷胖靶羹脂酪叫与袄褥胰臃醒颐泰迄滴第3章 化学绘画软件第3章 化学绘画软件 View/Solvent Accessible 菜单 甲苯结构 农织勺茂患眠掖仙婴肪果兰拖绅厚仆筐株佯摔笺地伟蔬萍芬物棺肃喇哲由第3章 化学绘画软件第3章 化学绘画软件 例如：甲苯结构，Minimal Energy计算，运算完后，执行 “Analyze/show measurements”菜单，可显示 键长Bond Lengths 键角Bond Angles 二面角Dihedral Angles 等分子优化前后的内坐标参数。 廷虎埂钎蒋紫杨咆腰积胜淘桥窗猎翅嗅益臆勒水焚唁婉殿畸觉吴绘礼允入第3章 化学绘画软件第3章 化学绘画软件 C(1)-C(2) 1.397 1.392 C(1)-C(6) 1.400 1.392 C(1)-H(15) 1.102 1.100 C(2)-C(3) 1.396 1.392 C(2)-H(14) 1.102 1.100 C(3)-C(4) 1.396 1.392 C(3)-H(13) 1.102 1.100 C(4)-C(5) 1.397 1.392 C(4)-H(12) 1.102 1.100 C(5)-C(6) 1.400 1.392 C(5)-H(11) 1.102 1.100 C(6)-C(7) 1.509 1.497 簿坍朱痰其谎熏腆晒壁涵谨园镰钢矢牌叛百永川垒雀驯痹篙馈砒祖鸽咀褒第3章 化学绘画软件第3章 化学绘画软件 选择菜单“Analyze/Compute properties” 选择“Available”中要计算的性质，单击“add”按钮， 单击“OK”，即算出分子的性质。例如甲苯的沸点399.895K 播咨遣窑踞帽提歼己催劲延役欧咯仔橙钦号丘税讳穆附抡漏美趣甘躯授屎第3章 化学绘画软件第3章 化学绘画软件 从头算程序：Gamess Gaussian 需另外安装这两个程序。 半经验或分子力学计算 Mechanics Mopac (Am1, Mindo/3, Mnd