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- 2017-02-09 发布于北京
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第二节 真核生物基因组DNA序列的复杂度
一、重复序列的检测
真核生物基因组DNA C值的巨大差异提出了一个重要的问题,是否C值愈大的物种就含有更多的基因?还是基因数目并未增加而是含有大量不编码蛋白质的重复序列DNA?如果是基因数目随着C值大小而增加,那么编码这些结构基因的单一DNA序列的数量也应随之增加,相反如基因组中DNA含大量不编码的重复序列,那么基因的数目就不一定与C值成比例增加。为此可通过复性动力学来检测基因组DNA序列的复杂性(sequence complesity of DNA poputation)。也就是通过DNA的变性(denaturation)和复性(renaturation)反应的动力学过程分析DNA序列的性质,由于复性的速率取决于互补的DNA序列之间的随机碰撞, 所以DNA复性是一个双分子二级反应。单链消失速度
C为单链DNA的浓度(单位是每升的核苷酸摩尔数);
ts);
kL/mol·s),k取决于阳离子浓度、温度、片段大小和DNA序列的复杂性。
t=0时,C=C0,表明所有DNA都是单链,C0为DNA总浓度。
复性的分数C/C0是起始浓度和经过时间的乘积C0t的函数,这样的函数绘成图称为C0t曲线(图7-3)。
从方程式可见控制复性反应的参数是C0t,如当t=t1/2时,即
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