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miRNA的研究进展
miRNA在病毒感染诱发的免疫反应研究进展
摘要: miRNA的发现给生物医药领域的研究带来了巨大的价值。miRNA通过结合mRNA引起基因转录后沉默,达到调控基因表达的目的。研究病毒感染细胞的miRNA表达谱是否可作为一种新的策略治疗病毒感染导致的疾病,本文就RNA病毒与miRNA、miRNA与RNA病毒的复制、病毒与细胞miRNA这三个方面的研究进展进行综述。
关键词:miRNA, 病毒RNA,细胞miRNA,病毒miRNA
miRNA的简介
成熟miRNA是一条长约18-24nt的单链RNA,并由前体miRNA加工而成。miRNA具有亚型,A.thaliana miRNA有稳定的miRNA亚型,比其本身多1-2个核苷酸。miRNA亚型与miRNA共表达,常常显示为差异argonaute 复合物联系。这些亚型是由父母剪接体miRNA的差异剪切形成的[4]。 miRNA首先在RNA聚合酶II的作用下转录出前体miRNA,再经过Dicer加工,形成22nt的成熟miRNA。成熟的miRNA将与RNA沉默复合体(RISC)相结合。其中,RISC是由miRNA和mRNA靶点、Argonaute蛋白家族成员和辅助因子组成[1]。其作用机理是miRNA与靶mRNA 3’-UTR内的靶序列互补配对,调节靶基因的表达[2]。并且,一般不完全的互补配对导致靶基因的翻译受到抑制。miRNA介导的翻译抑制或mRNA降解有可能在一种P小体中进行[3]。
真核生物基因组转录的98%是非编码RNA,占这么大比例的非编码RNA参与基因表达调控(101)。 miRNA参与多个生物过程,包括,转录、染色体结构、RNA形成和修饰、mRNA稳定性和翻译、以及蛋白稳定性和转运(12.,30,34)。
RNA病毒可以产生miRNA
miRNA是由22个碱基组成的非编码RNA。其最主要的生物功能就是引起转录后基因沉默和调控基因表达。目前,已有上百种保守细胞和病毒衍生的miRNA被识别和分离,发现miRNA对细胞转录组和病毒生命循环都具有调节作用。且发现在病毒衍生的miRNA探测中目前仅局限于DNA病毒的研究,造成一个RNA病毒不可能利用miRNA参与转录调控的假象。因此,将RNA病毒不产生miRNA这一现象归因于在复制上的限制,复制限制是随着基因组发夹的RNaseIII的过程而发生。3经过修饰的传染病毒A可以表达细胞水平的microRNA-124,microRNA发夹插入核外输出蛋白的内含子中,microRNA转录导致内源基因加工和功能miRNA-124的产生。这一研究表明,RNA病毒基因组整合一个发夹,不会使基因片段不稳定,也不改变miRNA介导的基因组靶位。因而,RNA病毒能够产生miRNA,并对病毒复制没有负面影响。
3 RNA病毒在宿主细胞中的复制
已有大量文献报道,病毒感染会显著影响细胞水平的miRNA表达,RNA病毒可与细胞miRNA直接互作或间接影响细胞miRNA的表达,从而达到放大RNA病毒复制的潜能。 已有研究显示病毒svRNA参与基因的复制,并可作为发现新药的靶标(文献)。1.svRNA通过与病毒多聚酶装置的互作影响流行病毒A从转录到复制的转换。敲除svRNA对mRNA和cRNA有轻微的影响。但是,会导致vRNA以片段特异性的方式急剧丢失,影响病毒基因组的保守性复制[1]。许多研究表明流行病毒A中svRNA的生物合成和分子特征的像细胞,可以利用RNA进行核酸与蛋白质水平的联系,诸如剪接,端粒保持,翻译。
svRNA的合成,RdRp具有切断vRNA片段和从RNA合成svRNA的功能。产生svRNA的快速方法是切断svRNA,但是svRNA的切断会破坏基因组模板,对病毒的生命循环是致命的。替代方法是cRNA合成svRNA,并且cRNA以独立于svRNA的方式产生。病毒从转录到复制的转换,关键在于cRNA的稳定性,这个结果可以由阻断svRNA主要导致vRNA的选择性丢失支持[27]。svRNA独立于cRNA的合成,也可由NP功能的研究支持,NP积聚与病毒从转录到复制转换有关,NP暂时阻断panhandle的二级结构,完整的cRNA才得以合成[48]。NEP/NS2[38]和结合svRNA的RdRp组成RdRp复制酶,转录酶是缺乏svRNA。
svRNA具有8种不同RdRp复制酶,并以片段特异的方式调控vRNA。在复制酶结构中,RdRp与svRNA的物理联系促使以片段特异性方式指导反式启动子的继续,并一直延伸到基因组的末端。相反,在病毒mRNA的合成中,由于RdRp顺式结合于vRNA模板的5末端,转录酶中也不存在svRNA促使5端形成polyA尾巴结构。
4.病毒感染后细胞miRNA的表达谱变化
病毒感染后细胞miRNA表达
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