生物化学第5章蛋白质的三维结构
第5章 蛋白质的三维结构 一、研究蛋白质构象的方法 抹香鲸肌红蛋白三维结构的x射线衍射研究 抹香鲸肌红蛋白三维结构的x 射线衍射研究 肌红蛋白分子中部分肽链的电子密度图 核磁共振法 肌红蛋白的一种二维氢谱 肌红蛋白血红素局部的结构 研究溶液中蛋白质构象的光谱学方法 紫外差光谱 Tyr在pH6和pH13的吸收光谱 荧光测定 荧光分光光度计工作原理图 酪氨酸的吸收光谱与荧光光谱 Trp、Tyr和Phe的荧光光谱 荧光测定的指标 荧光测定中猝灭剂的作用 荧光测定中荧光探针的作用 圆二色性Ⅰ 椭圆偏振和椭圆率 圆二色性Ⅱ 圆二色性Ⅲ 圆二色性Ⅳ 圆二色性Ⅴ 多聚赖氨酸不同构象的标准远紫外CD光谱 圆二色性Ⅵ 圆二色性Ⅶ 二、稳定蛋白质三维结构的作用力 稳定蛋白质三维结构的作用力图示 稳定蛋白质三维结构的几种键的键能 氢 键 范德华力 几种生物学上重要原子的范德华半径和共价键半径 疏水作用Ⅰ 疏水作用Ⅱ 胶束的形成Ⅰ 胶束的形成Ⅱ 疏水作用Ⅲ 20种常见氨基酸的亲水指数 盐 键 二硫键 三、多肽主链折叠的空间限制 完全伸展的肽链构象 几种不同的Φ角和ψ角 拉氏构象图 拉氏构象图 可允许的φ和ψ值(拉氏构象图) 四、二级结构:多肽链折叠的规则方式 1.α螺旋(αhelix) α螺旋的各种图示 α螺旋顶面观 α螺旋中的氢键连接 α螺旋的偶极矩 影响α螺旋形成的因素Ⅰ pH对多聚
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