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- 2017-02-16 发布于上海
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方差计算 夏海武制作 */56 资料变异程度 用以衡量群体数量资料的变异程度(也称离中性/分散程度)的参数主要有: 方差/均方(variance, V / S2); 标准差(standard deviation, S)。 总体资料的参数由样本的统计量估计: 方差的计算公式; 标准差的计算公式。 当样本容量大于30时,可用n代替n-1计算方差与标准差。 夏海武制作 */56 第三节数量性状遗传模型和方差分析 一、数量性状的遗传模型 二、表现型变异与基因型变异 三、常用的几种群体的方差 夏海武制作 */56 一、数量性状的遗传模型 1.表现型值的效应分解 性状表现由遗传因素决定、并受环境影响,可得: P = G + E. P 为个体表现型值(也即性状观察值); G 为个体基因型(效应)值,也称遗传效应值; E 为环境效应值,当无基因型与环境互作时,E=e为随机误差,符合正态分布N(0,σ2)。 不分离世代中,个体间差异完全由环境因素引起: 个体基因型相同,基因型效应值G也相同; 随机误差e是导致个体间表型差异的唯一原因。 分离世代中,个体间差异有两个方面的因素: 不同基因型个体的基因型值G不同,引起部分个体表型差异; 随机误差e也会引起个体表型差异。 夏海武制作 */56 2.遗传效应分解 对于多基因控制数量性状,分离群体中个体间基因型差异及其所引起的遗传效应可分为三类: 加性效应(A):由基因间(等位基因与非等位基因间)累加效应所导致的个体间遗传效应差异; 显性效应(D):等位基因间相互作用导致的个体间遗传效应差异; 上位性效应(I):非等位基因间相互作用所导致的个体间遗传效应差异。 因此有:G = A + D + I;P = A + D + I + E. 其中,D 与 I 不具有可加性,合称为非加性效应。 夏海武制作 */56 二、表型变异与基因变异 1.表型方差分量分解 根据性状效应值分解可得:VP = VG + VE 此时基因型与环境间无互作效应,其中: VP 为群体表型方差(由性状资料计算); VG 为群体基因型差异所引起的变异方差,称为基因型方差,也称为基因型方差; VE 为环境因素所引起的变异方差,称为环境方差;无互作时为机误方差(Ve, ). 不分离世代(P1, P2, F1)个体间无基因型差异,即:VG=0,因此:VP = VE ?可用不分离世代表型方差估计环境方差; 分离世代(如F2)中,VP = VG + VE 。 夏海武制作 */56 2.遗传方差分量 由于群体遗传变异有三种类型,其遗传方差也可进而分解为三种方差分量: 加性方差(VA):个体间加性效应差异导致的群体变异方差; 显性方差(VD):个体间显性效应差异导致的群体变异方差; 上位性方差(VI):上位性效应差异导致的群体变异方差。 因此有: VG = VA + VD + VI; VP = (VA + VD + VI) + VE. 此时,VD + VI 为非加性方差。 夏海武制作 */56 *(三)、几组概念对照表 变异 variation 效应值 value 方差 variance 表型 phenotype 表型变异 phenotypic ~ 表型值 phenotypic ~ 表型方差 phenotypic ~ 基因型 genetype 遗传变异 genetic ~ 基因型值 genetypic ~ 遗传方差 genetypic ~ 加性效应 additive effect 加性方差 additive ~ 显性效应 dominance effect 显性方差 dominance ~ 非加性 non-additive 上位性效应 epitasis effect 上位性方差 epitasis ~ 环境 environment 环境变异 environment ~ 环境效应 environment effect 环境方差 environment ~ 夏海武制作 */56 第四节 遗传力的估算及其应用 遗传率(heritability):遗传变异占总变异(表型变异)的比率,用以度量遗传因素与环境因素对性状形成的影响程度,是对杂种后代性状进行选择的重要指标。 广义遗传率(hB2):遗传方差占总方差(表型方差)的比率; 狭义遗传率(hN2):加性方差占总方差的比率。 夏海武制作 */56 遗传力的意义与两种定义比较 遗传力也称为遗传率,反应性状亲子传递能力: 遗传率高的性状受遗传控制的影响更大,后代得到相同表现可能性越高;反之则低。 加性效应与非加性效应的区别: 加性效应是基因间累加效应,可在自交纯合过程中保存并传递给子代,也称为可固定的遗传效应; 非加性效应的表现依赖于等位基因间杂合状态与非等位基因间的特定组合形式,不能在自交过程中保
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