高通量测序技术应用于慢性咽炎耐药基因检测.docVIP

高通量测序技术应用于慢性咽炎耐药基因检测 830000 摘要 目的 探讨高通量测序技术在慢性咽炎患者耐药基因分布中的应用。方法 选取2010年5月至2012年5月本院门诊收入的慢性咽炎患者360例，患者均符合慢性咽炎的诊断标准，采集患者咽后壁分泌物，提取质粒DNA并进行Solexa高通量测序，通过比对到NCBI质粒基因组数据库进行物种鉴定，通过与ARDB数据库进行比对进行耐药基因的鉴定。结果 共鉴定出307个质粒，分属25种病原菌，所占比例最高的为α-溶血性链球菌（12.87%），其次为副流感嗜血菌（9.86%）。通过与ARDB中已知的380种ARG比对，共有4015条序列与已知耐药基因序列一致。其中氨基糖苷类耐药基因、β内酰胺酶类耐药基因、大环内酯类耐药基因以及四环素类耐药基因占据了较高的比例。同时我们也检测到了一个多重耐药基因lsa。结论 高通量测序技术可以高效、准确检测慢性咽炎患者中的耐药基因，为临床慢性咽炎治疗方案的选择提供理论基础。关键词：慢性咽炎；耐药基因；高通量测序 Application of high-throughput sequencing technology in resistance gene detection in patients with chronic pharyngitis Wang Changei Department of Otolar