打开ExPASy主页ResourcesA..Z第七章蛋白质性质和结构分析.ppt

* 第七章 蛋白质性质和结构分析 (I) 生物信息学 MAGIFYFILFSFLFGICDAVTGSRVYPANEVTLLDSRSVQGELGWIASPLEGGWEEVSIMDEKNTPIRTYQVCNVMEASQNNWLRTDWITREGAQRVYIEIKFTLRDCNSLPGVMGTCKETFNLYYYESDNDKERFIRESQFGKTDTIAADESFTQVDIGDRIMKLNTEIRDVGPLSKKGFYLAFQDVGACIALVSVRVFYKKCPLTVRNLAQFPDTITGADTSSLVEVRGSCVNNSEEKDVPKMYCGADGEWLVPIGNCLCNAGHEEQNGECQACKIGYYKALSTDASCAKCPPHSYSVWEGATSCTCDRGFFRADNDAASMPCTRPPSAPLNLISNVNETSVNLEWSSPQNTGGRQDISYNVVCKKCGAGDPSKCRPCGSGVHYTPQQNGLKTTRVSITDLLAHTNYTFEIWAVNGVSKYNPSPDQSVSVTVTTNQAAPSSIALVQAKEVTRYSVALAWLEPDRPNGVILEYEVKYYEKDQNERSYRIVRTAARNTDIKGLNPLTSYVFHVRARTAAGYGDFSEPLEVTTNTVPSRIIGDGANSTVLLVSVSGSVVLVVILIAAFVISRRRSKYSKAKQEADEEKHLNQGVRTYVDPFTYEDPNQAVREFAKEIDASCIKIEKVIGVGEFGEVCSGRLKVPGKREICVAIKTLKAGYTDKQRRDFLSEASIMGQFDHPNIIHLEGVVTKCKPVMIITEYMENGSLDAFLRKNDGRFTVIQLVGMLRGIGSGMKYLSDMSYVHRDLAARNILVNSNLVCKVSDFGMSRVLEDDPEAAYTTRGGKIPIRWTAPEAIAYRKFTSASDVWSYGIVMWEVMSYGERPYWDMSNQDVIKAIEEGYRLPPPMDCPIALHQLMLDCWQKERSDRPKFGQIVNMLDKLIRNPNSLKRTGSESSRPNTALLDPSSPEFSAVVSVGDWLQAIKMDRYKDNFTAAGYTTLEAVVHMSQDDLARIGITAITHQNKILSSVQAMRTQMQQMHGRMVPV Molecular weight: 109801.8 Theoretical pI: 6.12 Membrane protein 蛋白质性质和结构分析 序列相似的蛋白质具有相似的三维结构 不同蛋白质中相同的结构域（domain）具有相似的功能 分析蛋白质的功能 许多生物信息学网站具有分析蛋白质性质和结构的软件 一级结构：氨基酸的排列顺序 二级结构：主要由氢键维系的结果（α-helix、β-sheet） 三级结构：二级结构进一步折叠形成的结构域 ExPASy (Expert Protein Analysis System) Swiss Institute of Bioinformatics (SIB) 的分析工具 蛋白质序列分析 蛋白质性质分析 蛋白质结构分析 2－D PAGE 分析 蛋白质性质和结构分析 Nucleic Acids Research 2003, 31:3784-8 CBS (Center for Biological Sequence Analysis) http://www.cbs.dtu.dk/services/ Technical University of Denmark (1993) Protein sorting Post-translational modifications of proteins Immunological features Protein function and structure ANTHEPROT http://antheprot-pbil.ibcp.fr/ 蛋白质性质和结构分析软件 DNAMAN / （一） 分析蛋白质的一级结构 一级结构：蛋白质的氨基酸序列 分析内容 蛋白质的氨基酸组成 等电点（pI） 分子量（molecular weight, Mw） 疏水性（hydrophobicity） 其它 1. 分析蛋白质的pI、Mw、氨基酸组成 打开ExPASy 主页,单击 “Resources A..Z” 选择“ProtParam”分析软件 在ProtParam主页粘贴序列进行分析 蛋白质的 pI、Mw、氨基酸组成等 2. 分析蛋白质的疏水性 打开ExPASy 主页，单击 “Resources A..Z” 选择“ProtS