研究神经放电序列模式变化的一种新方法.docVIP

研究神经放电序列模式变化的一种新方法 杜莹 陆启韶 王士敏 （北京航空航天大学 理学院 北京 100083 E-mail:duying@） 摘要：在神经系统中，信息是如何编码和传递的与放电序列模式的变化有着非常密切的关系。研究神经放电序列模式变化的传统方法主要有计算序列的平均放电频率、序列在固定时间间隔内的方差等。本文提出了一种新方法来刻画神经放电序列模式变化的特点，并且序列间的欧几里德距离也能够用这种方法定义出来。此方法也可研究序列对应不同激励时带来的模式变化。结果表明，和其它方法相比，它更加简单有效。 关键词：神经放电序列，模式变化，激励 A new method for characterizing variability of spike trains Ying Du Qishao Lu Shimin Wang Science School, Beijing University of Aeronautics and Astronautics, Beijing 100083, China E-mail:duying@ Abstract Characterizing patterns of a spike train is essential to the study of action potential (spike) inneuroscience and genetic sequences in molecular biology. In neuroscience, traditional methods for sequence comparisons rely on the mean spike count and its variance, measured in short time windows or distances between spike trains. More recently, a new method for encoding patterns of spike train has been introduced for characterizing features of neural spike trains, by which the Euclidean distances between spike train can also be simply defined. This new method is used to investigate the variability of responses to stimuli, and it is shown that it is more effective than the other methods. Keyword Neural spike train, variability of patterns, stimuli  一、前言 现在普遍认为，神经元是通过动作电位来进行长距离的信息传递的。既然认为每个动作电位都携带着一部分信息，那么动作电位到达的时间就决定了全部它所要表达的信息。研究时间序列的模式变化有很多方法，比如环刺激直方图（peri-stimulus time histogram, PSTH）——某事件发生前后神经元放电几率直方图；放电频率方程[1]以及其他一些特定的数字滤波器[2]; 放电序列的自相关和交互相关函数； ISI（inter-spike-interval）分布和回归映射[1]; 放电触发的平均激励算法[3]; 放电中心距离分析法[4，5]。 目前，序列模式的变化性已经成为揭示神经细胞在信息传递过程中生理机制的一种工具[6－10]。对于这方面的研究，长期以来关注的焦点是神经细胞对于稳态激励有什么反应上的变化，因为对于这种假设，可以用很多简便的分析方法，比如说对固定窗口放电数目的变化的统计等。但是，在大部分时候，相关的生物激励都不是稳态的。因此，最近研究人员又开始研究激励随着时间变化时，序列串和序列串之间的变化[11－13]。在做真实的脑实验中，好多种方法被用来探测序列的放电模式和序列串之间的变化关系，比如说固定窗口的放电的标准差和很多概率统计中的方法[11, 14]. 在神经科学中，距离也被经常用来刻画序列串的变化性和编码情况。在研究序列串的变化时，距离还是很重要的参数。在分子生物学中，距离被认为是两个序列之间的进化过程：两个序列串间的距离可以放到一个拓扑空间中去研究，让每个序列串对应一个点[15，16]。这样距离就可以用来衡量两个序列的变化性[17，18]和以及依靠参数变化的神经集群中去[4,