基于线粒体D-loop基因序列研究我国5种虾虎鱼类的系统进化关系.pdfVIP

第35卷第 1期 海 洋 渔 业 Vo1．35，No．1 2013年02月 Marine Fisheries Feb．， 2013 文章编号：1004—2490(2013)01—0001—07 基于线粒体 D-loop基因序列研究我国5种 虾虎鱼类的系统进化关系 侯新远 ，祝 斐 ，张丽娟 ，尹绍武 ，胡亚丽 ，贾一何 ， 李 丽 ，汪亚媛 ，张国松 (1．南京师范大学生命科学学院，江苏省生物多样性与生物技术重点实验室，南京 210023； 2．海南大学海洋学院，海 1：3 570228) 摘 要 ：利用PCR技术扩增河川沙塘鳢 (Odontobutispotamophila)、鸭绿沙塘鳢 (Odontobutisyaluensis)、中华沙 塘鳢 (Odontobutissinensis)、葛氏鲈塘鳢 (Perccottusglenii)及尖头塘鳢 (Eleotrisoxycephala)的线粒体 D—loop区 并测序，获得河川沙塘鳢、鸭绿沙塘鳢 、中华沙塘鳢 、葛氏鲈塘鳢及尖头塘鳢线粒体 D—loop区全序列分别为 853bp、853bp、1028bp、852bp、848bp，结合 GenBank中平头沙塘鳢 (Odontobutisplatycephala)、刺盖塘鳢 (Eleotr~acanthopoma)、黑体塘鳢 (Eleotr~melanosoma)、褐塘鳢 (Eleotr~fusca)、中华乌塘鳢 (Bostrychus sinensis)、云斑尖塘鳢 (Oxyeleotrismarmorata)、溪鳢 (Rhyacichthysaspro))等7种虾虎鱼类同源的D—loop区序 列 ，分析了这 12种虾虎鱼类的系统发育关系。所使用的同源序列长度为832—846bp，其中保守位点452个， 变异位点405个 ，简约信息位点258个 ，单态位点 145个 ，转换／颠换平均值为0．8。基于 Kimura2-parameter 模型的12种虾虎鱼类遗传距离范围为0．043～0．312，在Kimura2-parameter模型构建的邻接树和非加权配对 法系统树中，河川沙塘鳢、鸭绿沙塘鳢、中华沙塘鳢 、平头沙塘鳢聚为一大支，刺盖塘鳢、黑体塘鳢 、褐塘鳢、尖 头塘鳢、溪鳢 、葛氏鲈塘鳢聚为另一支。 关键词：虾虎鱼类；D—loop；系统进化 中图分类号：Q731 文献标识码：A Phylogeneticrelationshipsof5gobioideispeciesbasedon sequencesofmitochondrialDNA D-loop HOUXin—yuan，ZHUFei ，ZHANGLi-juan，YIShao．WU，HUYa．1．i．， 一 JIA Yihe ，LILi，WANG Ya-yuan ，ZHANG Guo—song 一 (1．KeyLaboratoryofBiodiverstyandBiotechnologyofJiangsuProvince，CollegeofLfieScience， NanjingNormal ，Nanjing 210023，China；2．CollegeofOcean，HainanU