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真核基因调控主要在转录水平上进行,受大量特定的顺式作用元件(cis-acting element)和反式作用因子(trans-acting factor,又称跨域作用因子)的调控,真核生物的转录调控大多数是通过顺式作用元件和反式作用因子复杂的相互作用来实现的。 2、转录模板 包括从转录起始位点到RNA聚合酶II转录终止处的全部DNA序列。 3、RNA聚合酶II 由至少10—20个亚基组成,有些亚基也在I、Ⅲ中共用。其中2.4×105最大亚基的羧基末端含有由7个氨基酸残基(Tyr-Ser-Pro-Thr-Ser-Pro-Ser)组成的多磷酸化位点重复序列,称为羧基末端结构域(CTD)。 4、RNA聚合酶II基础转录所需的蛋白质因子(以“TFII”表示) RNA聚合酶II需与20种以上的蛋白质因子结合形成转录起始复合物。 RNA聚合酶II起始的基因转录的终止位点的3′端都存在一个poly(A) 位点,该位点上游15~30 bp处的保守序列AATAAA对于初级转录产物的切割及加poly(A)是必需的。 poly(A)及AATAAA序列对于基因的转录和成熟意义重大,但RNA聚合酶II却不在该位点终止转录,而是在其下游0.5~2 kb序列。 增强子的特性: ① 增效效应十分明显 。 一般能使基因转录频率增加10—200倍,甚至增加上千倍。 ② 增强效应与其位置和取向无关。 ③ 大多为重复序列 。 一般长约50 bp,适合与某些蛋白因子结合。其内部常含有一个核心序列:(G)TGGA/TA/TA/T(G),是产生增强效应所必需的。 ④ 其增强效应有严密的组织和细胞特异性。 说明增强子只有与特定蛋白质相互作用才能发挥功能。 ⑤ 没有基因专一性,可以在不同的基因组合上表现增强效应。 ⑥ 许多增强子受外部信号的调控。 增强子的作用原理: (1)影响模板附近的DNA双螺旋结构,导致DNA双螺旋弯折或在反式因子的参与下,以蛋白质之间的相互作用为媒介形成增强子与启动子之间“成环”连接,活化基因转录; (2)将模板固定在细胞核内特定位置,如连接在核基质上,有利于DNA拓扑异构酶改变DNA双螺旋结构的张力,促进RNA聚合酶II在DNA链上的结合和滑动; (3)增强子区可以作为反式作用因子或RNA聚合酶II进入染色质结构的“入口”。 根据转录复合物中各个蛋白质在转录中 作用不同可分为三类: ①RNA聚合酶亚基,不具有基因特异性; ②转录起始或终止的辅助因子,不具有基因特异性; ③与特异调控序列结合的转录因子。 在拉链区的氨基端有约35个残基的碱性区(富含赖氨酸和精氨酸)。此区的作用是与DNA结合,它也形成?-螺旋。 亮氨酸拉链区的作用是将一对与DNA结合的区域拉在一起,以结合两个相邻的DNA序列。 bHLH区使各亚基的两个碱性区正确定向。 与bHLH区相邻的是强碱性的区域,它是与DNA结合必须的。 5、同源域蛋白 同源域:是指编码60个保守氨基酸序列的DNA片段,广泛存在于真核生物基因组内,同源转换基因与生物有机体的生长、发育和分化密切相关。许多含有同源转换区的基因具有转录调控的功能,同源转换区氨基酸序列很可能参与形成了DNA结合区。 在真核生物中,反式作用因子的功能受蛋白质-蛋白质之间相互作用的调节变得精密、复杂,完整的转录调控功能通常以复合物的方式来完成,这就意味着并非每个转录因子都直接与DNA结合。是否具有转录活化域成为反式作用因子中唯一的结构基础。通常依赖于DNA结合结构域以外的30—100个氨基酸残基。 转录活化有下列几个特征性结构: 1、带负电荷的螺旋结构。糖皮质激素受体AP1家族的Jun及GAI4有酸性的螺旋结构,能与TFIID复合物中某个通用基因或RNA聚合酶II本身结合,并有稳定转录起始复合物的作用。 2、富含谷氨酰胺的结构。Oct1/2,Jun、AP2、血清应答因子(SRF)有相同的富含谷氨酰氨的结构域。 3、富含脯氨酸的结构。CTF—NF1因子的羧基端富含脯氨酸(达20%—30%),很难形成α螺旋。 第三节 蛋白质磷酸化对基因转录的调控 细胞应答分为3个阶段: 外界信息的“感知”,即由细胞膜到细胞核内的信息传递; 染色质水平上的基因活性调控; 特定基因的表达,即从DNA→RNA→蛋白质的遗传信息传递过程。 由细胞膜到细胞核内的信息传递途径: ①细胞表面受体蛋白构象变化; ②细胞表面受体发生寡聚化。 一、受cAMP水平调控的A激酶 A激酶:指依赖于cAMP的蛋白激酶(PKA),其功能是将ATP分子上的末端磷酸基团加到某个特定蛋白质的丝
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