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.. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 程序安装简介 李会民 hmli@ 中国科学技术大学超级计算中心 2016-5-27 李会民 (中国科大超算中心) 程序安装简介 2016-5-27 1 / 10 .. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 应用程序的编译与安装简介 应用程序一般有两种方式发布： 二进制方式：用户无需编译，只要解压缩后执行安装程序或设置相 关环境变量等即可。如Gaussian1 源代码方式： 用户需要自己编译，且可按照需要修改编译参数以编译成最适合自 己的可执行程序，之后再设置环境变量等使用，如VASP2 源代码编译时经常用到的编译命令为make，编译配置文件 为Makefile或makefile，请查看make命令用法及Makefile文件说明 应用程序一般都有官方安装说明，建议在安装前，首先仔细查看一下， 如到其主页或查看解压缩后的目录中的类似：README、INSTALL、 doc等类似文件或目录。 1Gaussian：/，国内用户只能购买已编译好的二进制可执 行文件，有些国家和地区能购买到源代码 2VASP：http://www.vasp.at/ 李会民 (中国科大超算中心) 程序安装简介 2016-5-27 2 / 10 .. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 二进制程序的安装 以二进制方式发布的程序，安装相对简单，一般只要解压缩后设置好环 境变量即可，以Gaussian09为例： 将压缩包复制到某个地方，如/opt 解压缩：tar xvf gaussian09.tar.gz3 设置环境变量：修改~/.bashrc，添加： ##Add?for?g09 export?g09root=‘‘/opt’’ export?GAUSS_SCRDIR=‘‘/tmp’’ .?$g09root/g09/bsd/file ##End?for?g09   刷新环境设置：. ?/.bashrc或重新登录下。 3当前主流Linux系统，tar命令已能自动识别.gz和.bz压缩，无需再添加z或j参数。 李会民 (中国科大超算中心) 程序安装简介 2016-5-27 3 / 10 .. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 源代码程序的安装 I 源代码发布的程序安装相对复杂，需了解所采用的编译环境，并对 配置等做相应修改（主要修改编译命令、库、头文件等编译参数） 主要步骤一般为 查看主页等帮助 解压缩：tar xvf appsrc.tar.gz 进入解压缩的目录查看是否有README、INSTALL和doc等类似文件 和目录，有的话先查看 有configure文件的话，可以./confugure -h看看帮助及选项 生成配置：./confugure [OPTION]... [VAR=VALUE] 修改生成的Makefile等文件 编译：make 安装：make install 每种软件的具体安装步骤不一定相同，务必要看对应说明 李会民 (中国科大超算中心) 程序安装简介 2016-5-27 4 / 10 .. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . 源代码程序的安装 II 一些在confugure、Makefile中常见变量： –prefix：安装到的目录前缀 CC：编译C源文件的编译器命令 CLAGS：C程序编译参数 CPP：预处理参数 CXX：编译C++源文件的编译器命令 CXXFLAGS：C程序编译参数 F77：编译Fortran77源文件的编译器命令 F90：编译Fortran90及以后源文件的编译器命令 FC：编译Fortran源文件的编译器命令 FFLAGS：Fortran编译参数 INCLUDE：头文件参数 LIB：库文件参数 LINK：链接参数 OFLAG：优化参数 李会民 (中国科大超算中心) 程序安装简介 2016-5-27 5 / 10 .. . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . . Open MPI安装 查看安装说明：/do