原鸡基因cd8a生物信息学初步分析论文 学位论文.docVIP

原鸡基因CD8a生物信息学初步分析 内容摘要 本文的实验对象是原鸡的CD8a。本实验运用生物信息学方法，对本条核酸序列进行核酸一级结构和其表达产物的一级结构、二级结构以及三级结构进行初步分析。通过分析我们得出，该条序列长度为648bp，有多种酶的限制性酶切位点，与其他鸡形目的CD8a相似性很高，本条序列共编码216个氨基酸。氨基酸疏水性不高，有12个磷酸化位点，没有信号肽，有一个跨膜区，蛋白质二级结构主要是α螺旋，占22.69%；延伸链，占15.74%；无规卷曲，占61.57%，并且分布不连续。通过对其系统发生树的建立，三种方法构建的系统树，所表现的CD8a和其他物种同源序列之间的关系基本一致。 【关键词】:原鸡 生物信息学 CD8a 目录 一、综述 4 二、分析研究材料与方法 5 （一）研究材料 5 （二）研究方法及工具 5 （三）分析方法和具体步骤 6 三、预测结果与分析 8 （一）核酸序列一级结构分析 8 1．核酸序列基本分析 8 2.核酸序列的酶切图谱分析 9 3.碱基同源性初步分析 11 （二）氨基酸序列的初步分析 12 1.氨基酸序列的组成 12 2．磷酸位点的预测 14 3．氨基酸的疏水性和亲水性分析 14 4．氨基酸的跨膜区分布 15 5．信号肽区域的预测 16 （三）氨基酸高能结构的分析 17 1．氨基酸的二级结构分析 17 2．蛋