生物化学(中国医科大学临床药学)教学.doc

第一章 蛋白质的结构与功能 1.20种氨基酸的分类及特殊氨基酸 1）、非极性脂肪族氨基酸：甘氨酸Gly(无手性碳原子，无旋光，不属于L-α-氨基酸)、丙氨酸Ala(A)缬氨酸Vla(V)亮氨酸Leu异亮氨酸Ile脯氨酸Pro（亚氨基酸） 极性中性氨基酸：Ser、Cys（可形成二硫键，成为胱氨酸）、Met、Asn、Gln、Thr 芳香族氨基酸（不带电荷）：Trp、Tyr、Phe 酸性氨基酸（中性aq中带负电荷）：Asp、Glu 碱性氨基酸（中性aq中带正电荷）：Lys、Arg、His 2）、含羟基（-OH）和含磷酸化修饰位点氨基酸：丝苏酪（师叔咯）Ser、Thr、Tyr 含共轭双键有280nm紫外吸收氨基酸：色酪 2.GSH的结构及生物学功能 谷氨酸γ-羧基与半胱氨酸的氨基组成 保护体内蛋白质或酶分子中的巯基免遭氧化，使其处于活性状态 还原细胞内产生的H2O2，使其变成H2O GSH的巯基有嗜核特性，保护机体免遭毒物损害 3.蛋白质的一、二、三、四级结构 1）一级结构： 蛋白质的一级结构指肽链中氨基酸的排列顺序 氨基酸的排列顺序是从左到右的，即从N-末端到C-末端的 维持一级结构的作用力：肽键、二硫键 2）二级结构： 定义：蛋白质分子中某一段肽链的局部空间排列，即该段肽链主链骨架原子的相对空间位置，不涉及氨基酸残基侧链的构象。 维持二级结构的作用力：氢键 3）三级结构： 定义：整条肽链中全部氨基酸残基的相对空间位置。即肽链中所有原子在三维空间的排布位置。 维持三级结构的主要作用力：疏水键、氢键、盐键和Van der Waals力等。 4）四级结构： 蛋白质分子中各亚基的空间排布及亚基接触部位的布局和相互作用，称为蛋白质的四级结构。 亚基之间的结合力主要是：氢键、离子键 4.肽单元、蛋白质二级结构分类及α-螺旋的结构要点 1）肽单元：参与肽键的6个原子C(1、C、O、N、H、C(2位于同一平面，C(1和C(2在平面上所处的位置为反式（trans）构型，此同一平面上的6个原子构成了所谓的肽单元 2）蛋白质二级结构的形式： (-螺旋 (-折叠 (-转角 无规卷曲 3）(-螺旋结构特点 多肽链主链围绕中心轴形成右手螺旋，侧链伸向螺旋外侧 每个螺旋3.6个氨基酸，螺距0.54nm 每个肽键的亚氨基和第四个肽键的羰基氧形成的氢键保持螺旋稳定，氢键与螺旋长轴基本平行 5.Motif、结构域、subunit 1）Motif： 蛋白质分子中，二个或三个具有二级结构的肽段，在空间上相互接近，形成一个具有特殊功能的空间构象，被称为模体（motif）。 2）结构域： 大分子蛋白质的三级结构常可分割成一个或数个球状或纤维状的区域，折叠得较为紧密，各行使其功能，称为结构域 3）subunit： 有些蛋白质分子含有二条或多条多肽链，每一条多肽链都有完整的三级结构，称为蛋白质的亚基（subunit）。 6.蛋白质的理化性质（蛋白质变性、蛋白质等电点） 1）蛋白质变性： 蛋白质变性（denaturation）：在某些物理或化学因素作用下，使蛋白质的空间构象破坏，即有序的空间结构变成无序的空间结构，从而导致其理化性质改变和生物活性的丧失。 2）蛋白质等电点： 蛋白质的等电点（isoelectric point，pI）：当蛋白质溶液处于某一pH时，蛋白质解离成正、负离子的趋势相等，即成为兼性离子，净电荷为零，此时溶液的pH称为蛋白质的等电点。 附：pIpH时带正电！！！ 7.影响α-螺旋的结构因素 1）脯氨酸的刚性五元环，影响氢键形成，不形成α-螺旋 2）多个酸性或碱性氨基酸残基相邻，由于同性电荷彼此相斥，妨碍α-螺旋的形成 3）侧链较大的氨基酸残基，如天冬酰胺、亮氨酸等，也影响α-螺旋形成 第二章 酶 1.酶的分子结构、酶的活性中心、同工酶 1）酶的分子结构： 全酶=酶蛋白+辅助因子，只有全酶才具有催化活性，辅助因子包括：金属离子和小分子有机化合物 金属酶（metalloenzyme）：金属离子与酶结合紧密，提取过程中不易丢失。 金属激活酶（metal-activated enzyme）：金属离子为酶的活性所必需，但与酶的结合不甚紧密。 金属离子的作用： 参与催化反应，传递电子； 在酶与底物间起桥梁作用； 稳定酶的构象； 中和阴离子，降低反应中的静电斥力等 小分子有机化合物称为辅酶： 辅酶在催化中的作用如下 酶的活性中心： 必需基团（essential group） 酶分子中氨基酸残基侧链的化学基团中，与酶活性密切相关的化学基团（活性中心的有：结合基团和催化基团）。 酶的活性中心（active center）或称活性部位：指必需基团在空间结构上彼此靠近，组成具有特定空间结构的区域，能与底物特异结合并将底物转化为产物。 3）同工酶： 定义：是