分子生物学2015-3-chromosome精编.ppt

SNP: 编码区和非编码区，非编码区多， 调控基因表达和产物活性。 人类99.9％的基因是相同的，而差异不到0.1％，不同人群仅有140万个核苷酸差异。这些差异是由“单一核苷酸多样性”（SNP）产生的，它构成了不同个体的遗传基础。在整个基因组序列中，人与人之间的变异仅为万分之一，从而说明人类不同“种属”之间并没有本质上的区别。 物理图（physical map）：指已知核苷酸序列的DNA片断（序列标签位点，sequence-tagged site, STS）为路标，以碱基对作为基本测量单位(图距)的基因组图。 转录图（expression profiling）or cDNA图，即表达序列标签EST expressed sequence tag）,一段已经测序的cDNA，可用于更快确定相关基因在基因组上的位置。 EST：通过从cDNA文库中随机挑选的克隆进行测序所获得的部分cDNA的5或3端序列称为表达序列标签（EST），一般长300-500bp左右。 既包括可转录序列，也包括非转录序列，是转录序列、调节序列和功能未知序列的总和。 核苷酸序列图（genome sequence） 分子水平的物理图 是整个人类基因组的核苷酸序列图，是分子水平上最高层次的、最详尽的物理图。 （1）确定人类基因组中约5万个编码基因的序列及其在基因组中的物理位置，研究基因的产物及其功能。 （2）了解转录和剪接调控元件的结构与位置，从整个基因组结构的宏观水平上理解基因转录与转录后调节。 人类基因组计划的科学意义： （3）从整体上了解染色体结构，包括各种重复序列以及非转录“框架序列”的大小和组织，了解各种不同序列在形成染色体结构、DNA复制、基因转录及表达调控中的影响与作用。（4）研究空间结构对基因调节的作用。有些基因的表达调控序列与被调节基因从直线距离上看，似乎相距甚远，但若从整个染色体的空间结构上看则恰恰处于最佳的调节位置，因此，有必要从三维空间的角度来研究真核基因的表达调控规律。 （5）发现与DNA复制、重组等有关的序列。DNA的忠实复制保障了遗传的稳定性，正常的重组提供了变异与进化的分子基础。局部DNA的推迟复制、异常重组等现象则导致疾病或者胚胎不能正常发育，因此，了解与人类DNA正常复制和重组有关的序列及其变化，将对研究人类基因组的遗传与进化提供重要的结构上的依据。 （6）研究DNA突变、重排和染色体断裂等，了解疾病的分子机制，包括遗传性疾病、易感性疾病、放射性疾病甚至感染性疾病引发的分子病理学改变及其进程，为这些疾病的诊断、预防和治疗提供理论依据。 （7）确定人类基因组中转座子、逆转座子和病毒残余序列，研究其周围序列的性质。了解有关病毒基因组侵染人类基因组后的影响，可能指导人类有效地利用病毒载体进行基因治疗。 （8）研究染色体和个体之间的多态性。这些知识可被广泛用于基因诊断、个体识别、亲子鉴定、组织配型、发育进化等许多医疗、司法和人类学的研究。此外，这些遗传信息还有助于研究人类历史进程、人类在地球上的分布与迁移以及人类与其他物种之间的比较。 Genomics(基因组学) is the study of the structure and function of whole genomes. The sequencing of whole genomes has revolutionized modern life sciences. * Promoter，转录水平上的开关 * * * * * 复杂多基因家族一般由几个相关基因家族基因构成，基因家族之间由间隔序列隔开，并各自作为独立的转录单位。 Organization of histone genes in the animal genome 基因簇（gene cluster） 一个基因家族成员紧密连锁成簇状排列在某一染色体上，称之为基因簇。在人类基因组中有12个大的基因簇，如组蛋白基因簇。 组蛋白基因簇的特点：30-40 copies． 重复单位：H1，H2A，H2B，H3、H4 无intron，Poly(A)- RNA． Pseudogene(假基因): 在多基因家族中，某些成员并不产生有功能的基因产物，但其结构和功能基因具有相似性，这些基因称为假基因。来源于功能基因但已失去活性的DNA序列。 A truncated gene残缺基因and a gene fragment Processed pseudogene P144, Figure 7-5 reverse transcrip