转录组学技术及其应用探讨.pptVIP

转录组学研究技术及其应用;目录：;一、转录组简介;1、概念;2、转录组学;3、相关知识;（2）基因组学 ;1;（3）蛋白质组学 ;;;代谢组学研究进展;二、主要技术及其原理; 1、基因芯片技术(Microarray) 在转录组研究中应用最早及最广泛的为基因芯片技术(Microarray)，首先从待检测样品中提取RNA，并利用荧光标记的核苷酸将其反转录成cDNA，经过标记的核苷酸序列可与基因芯片特定位点上的探针杂交，经检测杂交信号而获取细胞基因表达信息。;基因芯片原理图;2、基因表达系列分析技术(SAGE) 基因表达系列分析技术 技术是一种基于测序技术、开放式的、快速高效的分析细胞基因表达状态的方法，该技术不需任何基因序列的信息，能够全局性地检测所有基因的表达水平。;3、大规模平行测序技术( MPSS) MPSS 技术是对SAGE 技术的改进，但其原理都是基于短标签测序(Tag-based sequencing)的方法。MPSS技术可获得更长的短标签，因而精度更高；此外，MPSS 技术特有的微球荧光测序可直接高通量读出序列，简化了测序过程。;4、RNA测序技术(RNAsequencing，RNA-seq) RNA 测序技术(RNA-seq)新一代高通量基因组测序仪的迅速发展(Solexa，454 GS-FLX，SOLiD，tSMS)不仅给基组领域带来革命性的突破，同时也给转录组检测方法带来重大革新。采用类似SAGE 技术和MPSS 技术的理念，新一代高通量基因组测序仪可以通过测定细胞全部转录产物序列，通过序列比对得到最后的转录组，一个新的测定转录组的“RNA 测序”法出现了，该技术称为RNA 测序技术(RNA-seq)。RNA-seq技术可以提供更多信息，可以得到用基因芯片难以得到的转录可变剪接序列；该技术对低表达基因的检测更加准确，并且可以定量确定转录水平。 ; ;1;RNA-Seq 技术优势;;三、与蛋白质组研究进展比较;四、转录组学应用;1、转录组在代谢工程领域的应用;1;2、转录组学在药用植物研究中的应用; 通过对物种的转录组进行描述，能够对理解物种的生物学和生物化学的各个方面提供新的信息。虽然药用植物有效成分的化学和药理学研究已经具有良好的基础，但是在天然活性成分生物合成途径和调控方面研究还很薄弱。目前，该领域的研究主要集中在长春花、青蒿、红豆杉和甘草等少数物种，这些研究多采用单基因研究策略。例如Collu G.等将候选细胞色素P450 基因转化长春花的悬浮细胞，验证了其具有10-香叶醇羟化酶的催化功能；SekiH.等利用昆虫外源体内共表达和酵母体外表达检验酶活的方法鉴定了甘草中的三萜甘草酸合成关键酶基因；Wildung MR Croteau R. A采用同源探针筛选太平洋参紫杉cDNA文库并结合GC-MS的方法，鉴定了紫杉醇生物合成中的关键酶TaxadieneSynthase 基因;;3、转录组学在植物细胞特性的改造方面的应用　　　;;五、参考文献;