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Chapter11.Gene manipulation;1. 分子生物学相关技术;1.1、Gel Electrophoresis;;;琼脂糖凝胶电泳 ;Agarose gel electrophoresis ;凝胶染色 ;;聚丙稀酰胺凝胶电泳;分子量范围 适用的凝胶浓度/(%)
蛋 白 质
?104 20-30
1~4×104 15-20
1-5×104~1×105 10-15
1×105 5-10
?5×105 2-5
核酸(RNA)
?104 15–20
104~105 5-10
105~2×106 2-2.6 ;核酸分子杂交 (nucleic acid hybridization )
在DNA复性过程中,如果把不同DNA单链分子放在同一溶液中,或把DNA与RNA放在一起,只要在DNA或RNA的单链分子之间有一定的碱基配对关系,就可以在不同的分子之间形成杂化双链(heteroduplex) 。;;Blotting 印迹技术;Probe 探针技术 ; Labeling nucleic acid;印迹技术的类别及应用 ;1.2.1 Southern blotting DNA印迹技术;DNA的制备;1.2.2 Northern blotting RNA印迹技术;1.2.3 Western blotting蛋白质印迹技术;三种印迹技术的比较;;聚合酶链式反应; ;5?;Cycle 3;PCR的基本反应步骤;模板DNA
特异性引物
耐热DNA聚合酶
dNTPs
Mg2+ ;Template;PCR thermal cycler;PCR产物的琼脂糖凝胶电泳分析;5′ AGAACATGGTGCGCAGGTTCTTGGTGACCCTCCGGATTCGGCGCGCGTGCGGCCCGCCGCGAGTGAGGGTTTTCGTGGTTCACATCCCGCGGCTCACGGGGGAGTGGGCAGCGCCAGGGGCGCCCGCCGCTGTGGCCCTCGTGCTGATGCTACTGAGGAGCCAGCGTCTAGGGCAGCAGCCGCTTCCTAGAAGACCAGGTCATGATGATGGGCA 3′ ;DNA测序技术基础:;Maxam Gilbert chemical method
Sanger’s enzymic method
;1.4.1 Maxam-Gilbert法(化学裂解法);4组特异的化学反应:
①G反应:硫酸二甲酯使G的N7甲基化,加热引起甲基化鸟嘌呤脱落,多核苷酸链可在该处断裂。
②G+A反应:用甲酸使A和G嘌呤环上的N原子质子化,从而使其糖苷键便的不稳定,再用哌啶使键断裂。
③T+C反应:用肼使T和C的嘧啶环断裂,再用哌啶除去碱基。
④C反应:当有高盐存在时,只有C与肼反应,并被哌啶除去。
; 化学降解G反应模式图 ; 化学裂解法的示意图;1.4.2 dideoxy chain termination双脱氧链末端终止法; ATP、dATP和ddATP的结构; ;双脱氧末端终止法原理; 末端终止部位;;;1.4.3 DNA??序自动化原理;;1.4.4 RNA sequencing;Sequence database
sequence database online
美国生物工程信息中心(GenBank)
基因组序列数据库(GSDB:Genome sequence database) :80/gsdb
欧洲分子生物学研究所(EMBL )
http://www.ebi.ac.uk
日本DNA数据库(DDBJ:DNA data bank of Japan) http://www.nig.ac.jp
sequence database software (DNA club、GCG、DNAman);2. DNA cloning;2.1 Conception;基因重组:不同的DNA分子间发生共价连接形成重组DNA 分子。;基因克隆的技术路线
目的基因 载体
;;2.1.2 V
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