基因组岛的建模与识别.ppt

;.;·研究背景;基因组岛的研究价值;何为基因组岛?;.;.; 项目的研究目标; 项目的研究内容;;实验的可行性分析;成果提供形式及初步预实验结果;现有算法详细列表;.; BLAST;.;窗口化方法 使用20kb的窗口在Bacillus cereus（蜡样芽孢杆菌）和Bacillus anthracis（炭疽芽孢杆菌）的全基因组上滑动所得到的GC含量的分布图。 ; Z-curve;对于一个AT丰富的基因组，Zn是近似的关于n的单调增的线性函数。反之，在GC含量比较丰富的区域，Zn是近似的关于n的单调减的函数。 曲线Zn~n可以用一条直线使用最小二乘法拟合。该曲线为Z=kn，易知，它对应的基因组的GC含量是稳定的。 令Zn’=Zn-kn，GC含量的改变被放大。（？？） 这样，Zn曲线和直线的偏差，即Z’曲线就可以突出地刻画基因组内GC含量的偏差了。;Z’曲线的几何意义; Z’曲线的几何意义;累积GC含量轮廓图;累积GC含量轮廓图;原核生物基因组岛的 建模与识别