基因体注解.ppt

簡介基因體 註解工具;何謂基因體;人類基因體解讀計畫;;人類基因體計劃的目的與應用;為何要做基因體的註解工作？(Genome annotation) ; SARS 之 RNA genome 定序後，首要之工作即是把序列上之基因位置及功能標示出來。這項工作稱為基因體註解 (genome annotation)。其中生物資訊中的序列比對 (sequence alignment) 技術即可運用於此。 此項基因體註解工作，需仰賴資料庫中其他的冠狀病毒 (coronavirus) 之基因功能註解，由序列的相似性及區域來推斷 SARS 病毒中重要的結構蛋白 (structure protein) ，如 spike protein (S), membrame protein(M), small membrane protein (E) nucleocapsid protein ，以及聚合脢等非結構蛋白 (NSPs) 之基因位置。;Central Dogma of Molecular Biology ;ATG Initiation codon;基因體註解;基因體註解;基因體註解工具;/applications/mfold/;ExPASy Molecular Biology Server;Translate - Translates a nucleotide sequence to a protein sequence;Transeq - Nucleotide to protein translation at EBI (EMBOSS);BCM - Nucleotide to protein translation at MBS ;Backtranslation - Translates a protein sequence back to a nucleotide sequence ;核酸序列分析ORF finder;ORF Finder : open reading frames finder;GENSCAN: Identification of complete gene structures in genomic DNA;作業一;簡介蛋白質體 註解工具;Genomics vs. Proteomics;Proteome;Generalized proteomics schema;Proteomics;蛋白體註解;蛋白質序列分析at ExPAsy Server;蛋白質序列分析 at CBS (The Center for Biological Sequence Analysis );PDB - An Information Portal to Biological Macromolecular Structures;TBI – Taiwan Bioinformatic Institute;蛋白質序列分析;作 業 二