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11 RNA的生物合成;11.1 模板和酶;;DNA的大小与基因
生物体 DNA 分子的大小并不等于基因的总和,特别是高等真核生物,DNA 分子上非编码区远比编码区长得多。
而真正为蛋白质 (酶)编码的基因仅仅占 DNA 分子的一小部分。
不编码基因而是一些不被转录的调控区,它们具有主宰基因转录和表达的功能,是基因不可缺少的部分。 ;
编码一种或几种蛋白质的全部氨基酸的核苷酸顺序,称为基因(gene)和基因组。
通常也把这些编码蛋白质的基因片段称为结构基因。
在 DNA 分子上还有些片段是为 rRNA 和 tRNA 编码的核苷酸,这些片段有时也称为基因。 ;重复基因:
DNA 中有些基因是重复的,称为重复基因。 原核生物中的重复基因数较少,真核生物中重复基因则很丰富。
如 核蛋白体 rRNA 的基因数,酵母细胞内为140 个,而果蝇则达数千个。又如酵母的 tRNA 基因:为每一种不同的 tRNA 编码的基因平均达 10 个重复基因。这种多重复基因的现象,是为适应细胞的分裂和增殖的需要。 ;基因重叠 :
在一些病毒中存在基因重叠的现象。
;不连续基因:
真核生物许多基因是不连续的,即:一个完整的基因被一个或更多个插入的片段所间隔。
这些插入片段可有几百乃至上千个碱基对,它们不编码任何蛋白质分子或成熟的 RNA。
内含子: 把这些插入而不编码的序列称为内含子(intron)。
外显子:把被间隔的编码蛋白质的基因部分称为外显子。
; DNA 的转录只转录基因部分其中包括内含子和外显子部分。
因而转录出来的所有 RNA 都必须经过加工,除去其中的内含子 并经复杂的修饰 才能成为成熟的各种 RNA,其中的 mRNA 才能成为合成蛋白质的模板。;11.1.1 转录模板;;11.1.2 RNA聚合酶;RNA 聚合酶 RNA聚合酶催化底物合成时是形成 磷酸二酯键。合成的方向是5’→3’:即 RNA 聚合酶 是沿着模板链的 3’ →5’ 方向移动。RNA 聚合酶的条件: (1)模板,双链 DNA 或单链 DNA 均可作模板。 (2)活化的底物,需要 4 种三磷酸的核苷酸: ATP, GTP、 UTP 及 CTP 为反应底物。 (3)二价金属离子,主要是 Mg2+ 和 Mn2+ 。 ;RNA 聚合酶含有两个核苷酸结合位点:;;11.1.2.1 原核生物的RNA聚合酶;各亚基的作用:;11.1.2.2 真核生物的RNA聚合酶;11.1.3 模板与酶的辨认结合;;原核生物的启动子:;RNA pol对与 -35区辨认结合后,酶向下游移动,到达Pribnow盒,酶已跨入了转录起始点,形成相对稳定的酶–DNA复合物,就可以开始转录。;
在-25 区有TATA盒,又称为Hogness盒,基本上都由A、T碱基所组成,其功能与聚合酶的定位有关,DNA双链在此解开并决定转录的起始位点。
在-75区有CAAT盒,其一致的序列为GGTCAATCT,CAAT盒与转录的起始频率有关。
除启动子外,真核生物基因组中还有一个称为增强子(enhancer)的序列,它能极大地促进启动子的转录活性。;增强子作用特点:① 能在很远距离(大于几kbp)对启动子产生影响;② 无论位于启动子上游或下游都能发挥作用;③ 其功能与序列取向无关;④ 无生物种属特异性;⑤ 受发育和分化的影响。
;11.2 以DNA为模板合成RNA的过程;11.2.1 转录起始;11.2.1.1 原核生物的转录起始;11.2.1.2真核生物的转录起始;11.2.2 转录延长; ;转录的错误频率:
RNA 聚合酶没有核酸外切酶活性,不能对进入RNA 链的核苷酸进行校正,所以转录的错误频率是每 104 或 105 中有一个错误,是 DNA 复制中错误的 105 倍。这种准确性虽很低,但由于 RNA 的转录产物很多,极少数有缺陷的转录产物大概不会产生有害的影响。;;11.2.3 转录终止;11.2.3.1原核生物的转录终止;;11.2.3.2真核生物的转录终止;11.3 以RNA为模板合成RNA的过程;11.4 RNA的转录后加工;11.4.1 mRNA的转录后加工; ;(2)真核生物的mRNA的转录后加工;真核生物m
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