毕业论文-基于ChIP-W的ChIP-Seq的数据分析模块的建立.docVIP

华中农业大学2011届本科毕业论文 基于ChIP-W的ChIP-Seq的数据分析模块的建立  PAGE 16  PAGE I 目 录  TOC \o 1-3 \h \z \u  HYPERLINK \l _Toc295928763 摘 要  PAGEREF _Toc295928763 \h II  HYPERLINK \l _Toc295928764 关键词  PAGEREF _Toc295928764 \h II  HYPERLINK \l _Toc295928765 Abstract  PAGEREF _Toc295928765 \h II  HYPERLINK \l _Toc295928766 Key words  PAGEREF _Toc295928766 \h II  HYPERLINK \l _Toc295928767 1前言  PAGEREF _Toc295928767 \h 1  HYPERLINK \l _Toc295928768 1.1 问题的提出  PAGEREF _Toc295928768 \h 1  HYPERLINK \l _Toc295928769 1.2 国内外研究现状  PAGEREF _Toc295928769 \h 2  HYPERLINK \l _Toc295928770 2背景知识介绍  PAGEREF _Toc295928770 \h 2  HYPERLINK \l _Toc295928771 2.1ChIP  PAGEREF _Toc295928771 \h 2  HYPERLINK \l _Toc295928772 2.2ChIP-W  PAGEREF _Toc295928772 \h 3  HYPERLINK \l _Toc295928773 2.3ChIP-Seq  PAGEREF _Toc295928773 \h 3  HYPERLINK \l _Toc295928774 3MOTIF定义与建模  PAGEREF _Toc295928774 \h 3  HYPERLINK \l _Toc295928775 3.1MOTIF定义  PAGEREF _Toc295928775 \h 3  HYPERLINK \l _Toc295928776 3.2MOTIF建模  PAGEREF _Toc295928776 \h 4  HYPERLINK \l _Toc295928777 3.2.1串模型  PAGEREF _Toc295928777 \h 4  HYPERLINK \l _Toc295928778 3.2.2矩阵模型  PAGEREF _Toc295928778 \h 5  HYPERLINK \l _Toc295928779 3.2.3可视化模型  PAGEREF _Toc295928779 \h 5  HYPERLINK \l _Toc295928780 4MOTIF识别的常用方法  PAGEREF _Toc295928780 \h 6  HYPERLINK \l _Toc295928781 4.1EM算法  PAGEREF _Toc295928781 \h 6  HYPERLINK \l _Toc295928782 4.2计数法  PAGEREF _Toc295928782 \h 8  HYPERLINK \l _Toc295928783 4.3GIBBS采样算法  PAGEREF _Toc295928783 \h 8  HYPERLINK \l _Toc295928784 5吉布斯采样算法  PAGEREF _Toc295928784 \h 8  HYPERLINK \l _Toc295928785 5.1吉布斯采样算法的基本算法  PAGEREF _Toc295928785 \h 8  HYPERLINK \l _Toc295928786 5.2吉布斯采样算法识别MOTIF  PAGEREF _Toc295928786 \h 9  HYPERLINK \l _Toc295928787 5.3吉布斯采样算法识别MOTIF的仿真实验  PAGEREF _Toc295928787 \h 12  HYPERLINK \l _Toc295928788 5.4吉布斯采样算法识别MOTIF实验结果的分析及其结论  PAGEREF _Toc29