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蛋白质三维结构相似性比较方法综述.pdf
第 卷 第 期 计算机辅助设计与图形学学报 ，
I8 I0 Vol. I8 No. I0
年 月 ，
2006 I0 J OURNAL OF COMPUTER- AI DED DESI GN COMPUTER GRAPHI CS Oct. 2006
!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!!
蛋白质三维结构相似性比较方法综述
彭群生 胡 敏
（浙江大学 国家重点实验室 杭州 ）
CAD CG 3I0058
（ ）
peng !cad. zj u. edu. cn
摘 要 蛋白质空间结构的相似性比较是生物信息学领域的一个研究热点，近年来出现了不少蛋白质三维结构相
似性比较方法 文中以蛋白质三维结构的表示为线索，对目前已有的蛋白质三维结构相似性比较的典型方法进行分
.
类，分析并归纳了各种方法的适用性
.
关键词 蛋白质三维结构表示；蛋白质三维结构比较；相似性检索
中图法分类号
TP39I
—
Approaches for 3D protei n struct ure si milarity Comparison a survey
Peng Gunsheng Hu Mi n
（ ， ， ）
State key Laboratory of CAD CG Zhejiang Unioersity Hangzhou 3I0058
Abstract Protei n structure si milarity comparison is one of t he research hotspots i n modern
，
bioi nf or matics. I n recent years many met hods were proposed which are capable of compari ng all available
，
protei n structures. Nevert heless difficulties still exist i n i nterpreti ng t he results of t hese comparisons. I n
， ，
t his paper we sort all t he current met hods i nto geometry based topology based and statistics based
， ，
approaches and i nvestigate t heir merits i n 3D protei n structure si milarity analysis. Fi nally we highlight
t he f uture research directions i n t his field.
； ；
Key words
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