02核酸化学.ppt

第二章 核酸化学 (nucleic acid) 一、核酸的概念和重要性 二、核酸的组成成分 三、DNA的结构 四、RNA的结构与功能 五、核酸的性质;;核苷酸;2.2.1核酸的分类、分布和功能;2.2.1 核酸的类别、分布和功能;;;嘌呤碱;嘧啶碱 胞嘧啶（C）胸腺嘧啶（T）尿嘧啶（U）;碱基的结构特征;胸腺嘧啶 只出现在DNA分子中 尿嘧啶 只出现于RNA分子中 ;核苷 核苷=核糖+碱基，以C-N糖苷键连接;核苷酸(ribonucleotide)的结构与命名;ATP的性质;cAMP和cGMP;;一、一级结构（primary structure）;与核酸研究有关的工具酶 1、核糖核酸酶类：一类专门水解RNA的酶 牛胰核糖核酸酶：高度专一性内切酶，作用位点嘧啶核苷—3’—磷酸与其他核苷酸之间的连键 核糖核酸酶T1：比RNaseA专一性更高，作用位点为鸟嘌呤核苷—3’—磷酸与其他核苷酸之间的连键 2、脱氧核糖核酸酶类：一类专门水解DNA的酶 牛胰脱氧核糖核酸???：无碱基专一性，它切断双链DNA或单链DNA成为以5’—磷酸为末端的寡聚核苷酸，平均长度为四个核苷酸,需Mg2+激活,最适PH7-8 牛脾脱氧核糖核酸酶：无碱基专一性，它降解DNA成为以3’—磷酸为末端的寡聚核苷酸，平均长度为6个核苷酸，需Na2+激活,最适PH4-5;限制性内切酶：简称限制酶，一类对DNA具有碱基专一性的内切酶 3、非专一性核酸酶类：既能作用于RNA也能作用于DNA 蛇毒磷酸二酯酶：从多聚核苷酸链的3’—羟基端开始，逐个切开5’—核苷酸与相邻核苷酸之间的酯键 牛脾磷酸二酯酶：从多聚核苷酸链的5’—羟基端开始，逐个切开3’—核苷酸与相邻核苷酸之间的酯键;RNA一级结构;四、DNA高级结构 （一）DNA的二级结构（secondary structure）;双螺旋模型要点;（2）磷酸和核糖组成的骨架位于双螺旋外侧，碱基位于螺旋的内侧。碱基环平面与螺旋轴垂直，糖基环平面与碱基环平面成90°角。 ;（3）螺旋的直径约为2 nm，每条链相邻两个碱基平面之间的距离为0.34 nm 每10个核苷酸形成一个螺旋，其螺矩（即螺旋旋转一圈）高度为3.4 nm。 ;（4）双螺旋内部的碱基具有严格的配对规律 腺嘌呤（A）=胸腺嘧啶（T） 鸟嘌呤（G）=胞嘧啶 （C） 这种配对关系，称为碱基互补 A和T之间形成两个氢键 G与C之间形成三个氢键 ;（5）螺旋表面形成大沟(major groove)及小沟(minor groove)，彼此相间排列。小沟较浅；大沟较深，是蛋白质识别DNA碱基序列的基础。 ;(6)DNA双螺旋结构的稳定 氢键:横向靠两条链间的互补碱基的氢键维持 碱基堆积力:纵向靠邻近碱基对之间的疏水的相互作用和范德华力构成碱基堆积力 离子键：介质中的阳离子（如Na+、K+和Mg2+）与磷酸基团的负电荷形成离子键，降低了DNA链磷酸基之间的静电排斥力 改变介质条件和环境温度，将影响双螺旋的稳定性 ;由2条反向多核苷酸链组成的右手双螺旋，但螺体较宽而短，碱基对与中心轴倾角为19度;几种DNA螺旋结构的参数 ;（二） DNA的三级结构（超螺旋结构）;正超螺旋(positive supercoil):盘绕方向与双螺旋方同相同 此种结构使分子内部张力加大， 旋得更紧 负超螺旋(negative supercoil):盘绕方向与双螺旋方向相反 这种结构可使其二级结构处于松缠状态，使分子内部张力减少，有利于DNA复制、转录和基因重组 自然界中，生物体内的超螺旋都呈负超螺旋形式存在 DNA的拓扑异构体之间的转变是通过拓扑异构酶来实现的 ;（三）DNA的功能;（一）信使RNA的结构与功能;mRNA核内向胞质的转位，促进核蛋白体与mRNA的结合 增加mRNA的稳定性 加速翻译起始的速度 ;* mRNA的功能 把DNA所携带的遗传信息，按碱基互补配对原则，抄录并传送至核糖体，用以决定其合成蛋白质的氨基酸排列顺序。;（二）tRNA的结构与功能--约占全部RNA的15%;氨基酸臂：由7对碱基组成，富含鸟嘌呤 3’末端都为…CpCpAOH，接受活化的氨基酸 5’末端大多为pG…，也有pC…的;3、tRNA三级结构的形状为倒写的L型 ;*４、tRNA的功能： 活化、转运氨基酸到核糖体，参与蛋白质的翻译。;1、分子较小，含较多的稀有碱基和非标准碱基配对;;（三）rRNA的结构与功能--是细胞内含量最多的RNA，约占RNA总量的80%以上 ;核酸是生物大分子，包括DNA与RNA 每种生物都具有其特定长度和数目的DNA分子 核酸分子的具体大小可用三种单位之一来描述 即长度、碱基数或碱基对数及分子量来表示 3000bp，相当于1μm的长度，分