ITS在区分疑似黄鹌菜上的应用.doc

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ITS在区分疑似黄鹌菜上的应用

吉 首 大 学 JISHOU UNIVERSITY 2010届毕业论文 题 目: ITS在区分疑似黄鹌菜上的应用 学 生 姓 名: 余玉良 学 号 20064074006 学 院: 生物资源与环境科学学院 专 业 年 级: 06级生物科学(师范 ) 指 导 教 师: 恩特马克?布拉提白 写 作 时 间: 2010年5月 目 录 摘 要 ………………………………………………………………………………………………….1 关键词……………………………………………………………….….………………………………...1 Abstract………...………………………………………………...……………………………………….1 Key words………………………………………………………………………………………………….2 前言 ………………………………………………………………..………………………………….2 1材料和方法:……………………………………………………………………………………………3 1.1 材料….………………..……………………………………………………………………………….3 1.1.1 材料来源………………………………………………………………………………………….3 1.1.2 主要试剂………………………………………………………………………………………….3 1.2 方法………………….……………………………………………………………………………….3 1.2.1 实验材料的采集、洗涤与称量………………………………………………………………….3 1.2.2 样品总DNA的制备……………….…………………………………………………………….3 1.2.3 样品rRNA基因ITS序列PCR扩增.………….……………………………………………….4 1.2.4 ITS序列分析…………………………………………………………………………………….4 2 实验结果………..…………………………………………………………………………………….4 2.1.黄鹌菜和异叶假福王草总DNA的制备…………………………………………………………….4 2.2 ITS序列扩增结果…….…………………………………………………………………………….5 2.3 序列及结构分析结果…..…………………………………………………………………………….5 2.4 同源性分析………….……………………………………………………………………………….7 3 讨论……………..…………………………………………………………………………………….8 参考文献..………………………………………………………………………………………………….9 吉首大学毕业论文  PAGE 10 ITS在区分疑似黄鹌菜上的应用 作者:余玉良 指导老师:恩特马克·布拉提白 (吉首大学生物资源与环境科学学院 中国吉首416000) 摘 要:本研究通过ITS序列对四种菊科植物进行了同源性分析。首先采用改良CTAB法提取总DNA,利用通用引物ITS5和ITS4)经PCR扩增出ITS序列并进行测序。在NCBI数据库中对测序结果进行同源性比对,调取同源性较高的ITS序列,通过聚类分析软件构建进化树。结果表明,四组样品5.8S rDNA序列显示高度的一致性。多态性位点大部分分布于ITS1和ITS2中,且ITS1中的多态性位点高于ITS2。基于ITS序列的系统发育树表明,聚类分析结果与形态学分类结果一致,说明ITS可以作为菊科植物种属、居群间的聚类分析指标。 关键词:菊科;福王草;黄鹌菜;PCR;ITS序列 Aplication of ITS on Distinguishing Seeming Youngia japonica YU Yu-liang Supervisor: Entomack Borrathybay (College of Biology and Environmental Science, JiShou University, JiShou, China, 416000) Abstract: Homology analysis of ITS Sequences from Paraprenanthes prenanthoi

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