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11DNA生物合成
第九章
DNA生物合成
周口师范学院生命科学系
;;DNA dependent DNA polymerase——DDDP
DNA dependent RNA polymerase——DDRP
RNA dependent RNA polymerase——RDRP
RNA dependent DNA polymerase——RDDP;第一节 DNA的半保留复制;DNA在复制时,以亲代DNA的每一股作模板,合成完全相同的两个双链子代DNA,每个子代DNA中都含有一股亲代DNA链,这种现象称为DNA的半保留复制(semi-conservative replication)。 ; ;DNA以半保留方式进行复制,是在1958年由M. Meselson 和 F. Stahl 所完成的实验所证明。
该实验首先将大肠杆菌在含15N的培养基中培养约十五代,使其DNA中的碱基氮均转变为15N。然后将大肠杆菌移至只含14N的培养基中同步培养一代、二代、三代。分别提取DNA,作密度梯度离心,将具有不同密度的DNA分离开。;DNA半保留复制研究实验结果示意图;1) 底物(substrate)
2) 模板(template)
3) 引发体和RNA引物
4) 各种酶系
5) 单链DNA结合蛋白
;以四种脱氧核糖核酸(deoxynucleotide triphosphate)为底物,即dATP,dGTP,dCTP,dTTP。;DNA复制过程中脱氧核糖核苷酸的聚合反应;DNA复制是模板依赖性的,必须要以亲代DNA链作为模板。亲代DNA的两股链解开后,可分别作为模板进行复制。 ;引物酶(primerase)本质上是一种依赖DNA的RNA聚合酶(DDRP),该酶以DNA为模板,聚合一段RNA短链引物(primer),以提供自由的3’-OH,使子代DNA链能够开始聚合。
引物酶需组装成引发体才能催化RNA引物的合成。; Dna A;3 HO;4) DNA复制的酶类;解旋酶; DNA聚合酶;5′ A G C T T C A G G A T A ? 3′
| | | | | | | | | | |;在原核生物中,目前发现的DNA聚合酶有三种,分别命名为DNA聚合酶Ⅰ(pol Ⅰ),DNA聚合酶Ⅱ(pol Ⅱ),DNA聚合酶Ⅲ(pol Ⅲ),这三种酶都属于具有多种酶活性的多功能酶。
参与DNA复制的主要是pol Ⅲ和pol Ⅰ。;pol Ⅰ为具有三种酶活性的单一肽链的大分子蛋白质,可被特异的蛋白酶水解为两个片段,其中的大片段保留了两种酶活性,即5→3聚合酶和3→5外切酶活性,通常被称为Klenow fragment。 ;pol Ⅲ由十种亚基组成不对称异源二聚体结构,其中?亚基具有5→3聚合DNA的酶活性,具有复制DNA的功能;而?亚基具有3→5外切酶的活性,与DNA复制的校正功能有关。 ;大肠杆菌DNA聚合酶Ⅲ全酶的结构和功能; 原核生物三种DNA聚合酶比较?;真核生物五种DNA聚合酶;真核生物的DNA聚合酶;DNA连接酶(DNA ligase)可催化两段DNA片段之间磷酸二酯键的形成,从而把两段相邻的DNA链连接成一条完整的链。
;DNA连接酶;DNA连接酶催化的条件
① 需一段DNA片段具有3-OH,而另一段DNA片段具有5-Pi基;
② 未封闭的缺口位于双链DNA中,即其中有一条链是完整的;
③ 需要消耗能量,在原核生物中由NAD+供能,在真核生物中由ATP供能。; DNA连接酶在复制中起最后接合缺口的作用。
在DNA修复、重组及剪接中也起缝合缺口作用。
是基因工程的重要工具酶之一。;解螺旋酶,又称解链酶或rep蛋白,是用于解开DNA双链的酶蛋白。
每解开一对碱基,需消耗2分子ATP。;DNA拓扑异构酶(DNA topoisomerase);10;解链过程中正超螺旋的形成;拓扑异构酶的作用特点
既能水解 、又能连接磷酸二酯键;拓扑异构酶Ⅰ;单链DNA结合蛋白(single strand binding protein, SSB),又称螺旋反稳蛋白(HDP),是一些能够与单链DNA结合的蛋白质因子。;SSB的生理作用;DNA在复制时,需在特定的位点起始,这是一些具有特定核苷酸排列顺序的片段,即复制起始点(origin) 。
在原核生物中,复制起始点通常为一个,而在真核生物中则为多个。;细菌和酵母菌中DNA复制起始点的碱基序列;大肠杆菌复制起点成串排列的重复序列;习惯上把两个相邻DNA复制起始点之间的距离(或DNA片段)定为一个复制子(replicon) 。
复制子是独立完成复制的功能
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