一种快速聚类方法在宏基因组物种分类研究中的应用.pdfVIP

目 录 摘 要 III 关键词 III AbstractIV Key WordsIV 1引言 1 1.1宏基因组学由来 1 1.2本文研究对象及采用的方法 2 1.3数据 2 2聚类分析 2 2.1聚类方法简介 2 2.2同源性比对聚类方法 2 2.3根据序列的相似度聚类的方法 4 2.4根据基因间相关系数聚类 5 2.4.1相对丰度 5 2.4.2相关系数计算 8 2.4.3相关系数计算算法优化 9 2.4.4根据相关系数聚类实现 10 2.4.5根据相关系数聚类优化 10 2.5聚类结果 11 2.6聚类结果后续分析 12 2.6.1分析思路 12 2.6.2关联性状分析 12 2.6.3聚类结论总结