不同物种启动子结构特征比较.pdfVIP

栽 培 育 种? 不 同物种启动子结构特征 比较? 尹悦佳? 李 楠? 崔喜艳? 岳 琳。? ??吉林省农业科学院 ， 长春 ??????；?吉林农业大学， 长春 ??????；?东北师范大学 ， 长春 ???????? 摘 要 比较基 因组分析表明植物 比低 等生物和动物含 有更 多的编码基 因。研 究人 员猜测这主要 由于植 物基 因组 中编码 转录 因子等调控蛋? 白的基 因数量 多于动物导致的 ，意味 着植 物的转录调控机 理可能更加复杂 。本研 究 ，针对拟 南芥 、大肠杆菌 以及人 类的全 基 因组启动子序? 列 开展 了???自由势能分布 ，弯折度 ，单核 苷酸组成分布及碱基偏 差等特征 的计算 分析 比较 ，期望从 启动子结构差 异特征 分析结果 中找 到? 支持 上述假说 的实验证 据。研 究结果表明 ：三个物种的启动手具有转录起始位点 ?????附近热稳定性最差 ，弯折度强的共性特征 。拟 南芥? 和人 类一样在???上游 ?一?????具有相似的能量 降落峰 ，而大肠杆 菌的最大降低峰 出现位 置与真核 生物不同 ，约在 ??????和一????口区域 。? 研 究还发现 拟南芥启动子 区域 自由势能 ，可弯折度 ，核苷酸的分布趋势与人类和大肠杆 菌相 比具有显著的差异特征 。拟 南芥???上游和下游? 区域 能量和弯折度的 变化 范围最大，并且具有独特的??偏好分 布特征 。我们的研 究结果从计算 生物 学角度上 阐明启动子结构差异是导致物? 种 间转 录因子识 别机制 不同的重要 原因之 一 ，实验 数据进 一步支持 植物启动子转录调控机 制比动物 更加 复杂的研 究推论 。? 关键词 启动子 ；? 弯折度 ；? 自由势能 ； 核苷醴组成分布? 中图分类号 ????? 文献标 志码 ?? 转录调控机制的问题始终被基因组学和分子生物学等领域? 得尤 为重 要 。? 的科学家所关注“】。作为转录调控 的重要元件 ，启动子序列承? 本研究以模式植物拟南芥全基因组范围的启动子序列为研? 载着核心 的调控信息 ，决定 了转录频率 以及转录起始 的时空特? 究对象 ，分析与转录密切相关的结构特征 ，如双螺旋 自由势能? 异性等??。深入分析启动子序列信息对于进一步解析基因表达? 势分布 ，弯折度差异，单核苷酸分布组成及碱基偏差分布等 ，? 调控机制意义重大 。近年来 ，传统 的实验方法对于启动子结构? 并将这些特征与人类 ???????和大肠杆菌 ??．?????启动子特? 特征的研究取得了较好的进展 ，发现 了核心启动子序列 ，如真? 征相比较。期望寻找到拟南芥与人 ，大肠杆菌启动子结构的