猪ACACA基因及其编码蛋白质的生物信息学分析.pdfVIP

一 ??一? 江苏农业科学 ????年第 ??卷第 ?期? 陶 隽，贾 青 ，魏星灿 ，等．猪 ?????基 因及其编码蛋 白质的生物信 息学分析???．江苏农业科学，????，?????：??— ??? 猪 ?????基 因及其编码蛋 白质的生物信息学分析? 陶? 隽?，贾? 青? ，魏 星灿?，胡慧艳?，邢增喜? ??．河北农业 大学动物科技学院 ，河北保定 ??????；?．国家北方山区农业工程技术研究 中心 ，河北保定 ???????? 摘要 ：为从分子水平研究猪脂肪合成过程 ，对脂肪合成关键酶 乙酰辅酶 ?羧化酶 一仅基因 ???????进行分析。采? 用生物信息学的方法 ，查找猪 ?????基因的 ???框 ，对基因 ???序列 的限制性酶切 位点进行 分析 ，并对其 编码蛋 白? 质的理化性质、二级结构、三级结构、拓扑结构、结构功能域进行预测分析。结果表明，猪 ?????基 因 ???区全长? ????????，其编码蛋白质含 ?????个氨基酸。二级结构以?螺旋与无规则卷曲为主，局部出现 ?转角 ，三级结构显示结? 果与二级结构预测结果相符。该蛋白质为亲水性蛋白质，?端无信号肽，为非分泌蛋白质；不含跨膜结构区，未定位于? 膜 内，预测其为膜外 区蛋 白质 ；亚细胞定位结果显示该蛋 白质为非细胞器蛋 白质 ，是胞质蛋 白质 的可能性最大 ；功 能域? 分析发现该蛋白质序列含有 ??结构域、??结构域、??????大亚基 ?端结构域、???— ?????折叠结构域、生物素基／硫? 辛酰基结合域等及一些蛋白质基序。该结果将为进一步研究猪 ?????基因与脂肪合成的关系提供基础资料。? 关键词 ：猪 ；?????基 因；蛋 白质 ；生物信息学? 中图分类号 ：????? 文献标 志码 ：?? 文章编号 ：????— ????????????— ????一??? 乙酰 辅 酶 ?羧 化 酶 ???????— ??????????????????????，? 学 的方法 ，分析猪 ?????基 因的一般特征 ，预测其 编码 的蛋? ????属于分子 间羧化转移 家族成员 ，在脂肪酸代谢过程 中起? 白质二级 、三级结构 ，并进 行蛋 白质 的拓扑结构 ，及其结构功? 着重要作用 。现 已确认 ，在 人和哺乳动物 中存 在两种形式 的? 能域的预测 ，旨在为进一 步开展猪脂 肪合成过程 的相关研究? ???：由 ?????基 因编码的 ???— ??????一??和 由 ?????? 提供基础资料 。? 基因编码 的 ???— ?????一??。前者作 为调节长 链脂肪 酸? ? 材料和方法? 合成 的限速酶 ，主要存在于脂肪酸生成 活跃的组织 ?如肝脏 、? 脂肪组织 和乳腺 ?，催化 乙酰辅酶 ?转化 成脂肪 酸合成起 始? ?．? 材