Cupriavidus campinensis BJ71菌株2,4-D降解基因tfdA生物信息学分析.pdfVIP

基因组学与应用生物学 ，????年，第 ??卷 ，第 ?期 ，第 ???—???页? ????????????????????????????，????，???．??，????，???— ???? 研究论文? ????????????????? ????????????????????????????菌株 ?，???降解基 因 ???生物信息学分析? 韩丽 珍 ?? 李 翠翠 ??? 赵德 刚?，?，?? ?贵州 大学绿色农药与农业生物工程 国家重 点实 验室 培育基 地，贵阳，??????；?贵州大学生命科学学 院山地植物保护 与种 质创新 省部共建教? 育部重点实验室，贵阳，????????；?贵州大学贵州省农业生物工程重点实验 室，贵 阳，??????? 通讯作者，??????????．???．??? 摘 要 本文 以 ?，?一二氯苯氧乙酸高效降解菌 ????????????????????????????菌株中克隆的 ???基因全序? 列为 研 究对 象 ，利用 生物 信 息学方 法分 析该基 因及 其推 测 出 的编 码 蛋 白理 化性质 、蛋 白的亲水性 或疏 水性 及? 亚细 胞定 位 、预测信 号肽 、跨 膜结 构域 、蛋 白二 级 结构及 模 体 、三 级 结构 等特 性 。结果 表 明 ，????菌株 的 ???? 基 因开放 阅读框 全长 ??????，系 统发 育树 表 明其属 于 ?族 ???基 因 。????蛋 白包 含 ???个 氨基 酸 ，分子 量? 为 ?????、理 论等 电点为 ?．??，是 一种 不含信 号肽 、定位 于细 胞质 中的可溶 性亲 水蛋 白。? 螺 旋和 无规卷 曲是? 该蛋 白主要 的二级结构元件 。用 ???????进行三级结构建模、????????????评估显示获得 了合理 可靠 的? ????蛋 白结构 模 型 。? 关键 词 ????? 降解基 因，???，系统 发 育树，生 物信 息学 分析? ????????????????????????????，?一?—?????????????????????????????????? ?????????????????? ????????????? ???????????? ???????????????? ?????????????????????????????????????????????????????????????????，? ???????????????????，???????，??????；??????????????????????????????????? ??????????????????????????????????????????????????????????????????????????????