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现代分子生物学
Modern Molecular Biology ;1. 基因
遗传学中的一个功能单位;
染色体DNA上的一个功能片段;
指导蛋白多肽或RNA分子合成的模板;
结构上含启动子,转录调控区,编码区和转录终止序列等。;2. 遗传学中心法则;3. DNA分子结构
;Maurice Wilkins ; DNA Double Helix;DNA 双螺旋特征:
两条DNA单链反向平行;
两条单链之间碱基配对互补:
A-T; G-C;
绕轴螺旋式盘绕
维系helix 结构的因素:
碱基配对形成的H键
A-T 2 个H键 (H Bond)
G-C 3 个H键
碱基堆积力 (Stacking);核酸分子内部的
高级结构; RNA的高级结构;4、核酸的光吸收特征
核酸分子对紫外光具有强吸收,260nm 处最强;OD260 可用于测定核酸浓度
在光径为1cm 时:
1 OD260 相当于 50ug/ml 双链DNA
40ug/ml 单链DNA/RNA
20ug/ml 寡聚核苷酸
OD260/OD280 比值可用于分析核酸的纯度
纯DNA溶液: OD260/OD280 为1.8
纯RNA溶液: OD260/OD280 为2.0
; Tm:能使50%DNA样品变性(解链)所需的温度;DNA变性与复性/核酸分子杂交 ; 核酸杂交可用于目的DNA的检测;6、DNA Replication(复制)
模板: 亲代DNA单链
材料: dNTP
酶: DNA polymerase 等
方式: 半保留复制
不连续复制
符合碱基配对原则
方向: 模板3’-5’
新链5’-3’
引物: 需要
;DNA sequencing
DNA 单链模板
dNTP
荧光标记的ddNTP
DNA pol.
引物
;; DNA测序图谱;20 years ago ……;7、Transcription(转录)
;rRNA 转录后加工; tRNA转录后加工;一、mRNA的转录后加工 ;mRNA 剪接; 精胺氧化酶(SMO)基因的交替剪接; mRNA的5`末端加上帽子结构:
7’-甲基鸟嘌呤; mRNA的3`末端加上PolyA尾巴;成熟mRNA的基本结构;cDNA;;Translation (翻译):蛋白质合成; 遗传密码子表;Escherichia coli O157:H45 [gbbct]: 4 CDSs (739 codons)
fields: [triplet] [frequency: per thousand] ([number])
UUU 25.7(19) UCU 37.9(28) UAU 29.8(22) UGU 12.2( 9)
UUC 4.1( 3) UCC 6.8( 5) UAC 23.0(17) UGC 0.0( 0)
UUA 17.6(13) UCA 35.2(26) UAA 5.4( 4) UGA 0.0( 0)
UUG 23.0(17) UCG 9.5( 7) UAG 0.0( 0) UGG 2.7( 2)
CUU 24.4(18) CCU 6.8( 5) CAU 4.1( 3) CGU 1.4( 1)
CUC 1.4( 1) CCC 0.0( 0) CAC 0.0( 0) CGC 0.0( 0)
CUA 0.0( 0) CCA 13.5(10) CAA 1.4( 1) CGA 0.0( 0)
CUG 20.3(15) CCG 6.8( 5) CAG 13.5(10) CGG 0
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