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- 2017-04-26 发布于四川
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免疫共沉淀原理-注意事项
免疫共沉淀
(Co-Immunoprecipitation, Co-IP)
单系金
一 实验原理
以(抗体和抗原)之间的专一性作用为基础的用于研究(蛋白质相互作用)的经典方法。是确定两种蛋白质在完整(细胞内生理性)相互作用的有效方法。
如果用蛋白质X的抗体免疫沉淀X,那么与X在体内结合的蛋白质Y也能沉淀下来。
问题:细胞怎样保持生理状态-不变性?
Y-X-抗X
CO-IP应用与IP区别
测定两种目标蛋白质是否在体内结合
确定一种特定蛋白质的新的作用搭档
CO-IP与IP只取决于检测焦点是初级靶分子(抗原)还是次级靶分子(相互作用蛋白)
实验基本原理
1.提取蛋白
2.在细胞裂解液中加入抗X的抗体
3.孵育后再加入Protein A或G(于Agarose bead上)
若细胞中有与兴趣蛋白结合的目的蛋白,就可以形成复合物:“Y—X—抗X抗体—Protein A或G
3.经变性、聚丙烯酰胺凝胶电泳,复合物又被分开。(xy抗原、x抗体)
proteinA/G有一个很重要的特性就是能与抗体的Fc段结合
agarose bead 琼脂糖珠
CO-IP原理图解
proteinA/G-琼脂糖珠复合物
Protein A是一种金黄色葡萄球菌细胞壁蛋白质,能特异性地与人和哺乳动物抗体(主要是IgG)的Fc区结合。
目前多用protein A/G预先结合在argarose beads上。
ProteinA/G的作用及具体原理
“捕获”抗体,形成复合物,
抗体-目的蛋白-ProteinA/G beads 非共价健结合
ProteinA/G-garose beads 共价结合
加样缓冲液-煮沸变性-离心 Protein A/G beads↓
EP管(抗体-目的蛋白-少量非特异性吸附蛋白)。
二 CO-IP特征
优点
(1 相互作用的蛋白质都是经翻译后修饰的,处于天然状态
(2 蛋白的相互作用是在自然状态下进行的,可以避免人为的影响
(3 可以分离得到天然状态的相互作用蛋白复合物
二 CO-IP特征
局限性
(1 可能检测不到低亲和力和瞬间的蛋白质-蛋白质相互作用
(2 两种蛋白质的结合可能不是直接结合,有第三者在中间起桥梁作用;
(3 必须在实验前预测目的蛋白是什么,以选择最后检测的抗体,若预测不正确,实验就得不到结果。
三 实验流程
提取细胞总蛋白 ↓
↓ 离心,上清电泳(抗原抗体)
准备PA珠子,PBS洗3遍
↓
PA珠子加入蛋白裂解液(去除非特异性蛋白背景)
↓
离心去PA珠子,取上清
↓
测蛋白浓度 (BCA法)
↓
加一抗反应(4℃过夜)
↓
加PA珠子捕捉复合物 (室温1h或4℃过夜)
↓
离心,收集沉淀,预冷RIPA Buffer洗3遍
↓
上样缓冲液悬浮沉淀,加热游离抗原、抗体、珠子 ↓
↓
四 实验结果分析
SDS
Western blotting分析
质谱分析检测目的蛋白
SDS结果分析
标难曲线只对同一块凝胶上的样品的分子量测定才具有可靠性。
以每个蛋白标准的分子量对数对它的相对迁移率作图得标准曲线,量出未知蛋白的迁移率即可测出其分于量。
一抗
一抗
一抗(兔抗Actin)
曝光后的蛋白条带
二抗 (辣根酶标记的羊抗兔IgG)
ECL
X光片曝光显影
ECL 试剂
含有转印蛋白的PVDF膜
+
+
转印膜上蛋白检测示意图
WB结果分析
CO-IP与质谱分析流程
三 实验的关键
1. 实验最需要注意点就是抗体的性质。特别是多抗的特异性是问题。
2. 为防止蛋白的分解、修饰,溶解抗原的缓冲液必须加蛋白酶抑制剂,低温下进行实
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