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三章节 蛋白质
第三章
蛋 白 质;第三章 蛋白质(protein) ;第三章 蛋白质(protein) (123-317页 第3,4,5,6,7章);第一节 氨基酸—蛋白质的构件分子;(二)氨基酸的分类
1、根据侧链R基团是否有极性
非极性氨基酸 Ala 、Val、 Ile、 Pro、 Phe、 Trp、 Met
极性氨基酸 不带电极性:Gly Ser Thr Cys Tyr Asn Gln
带负电:Asp Glu
带正电:Lys Arg His
2、根据分子中氨基与羧基数目
酸性氨基酸:Asp Glu
碱性氨基酸:Lys His Arg
中性氨基酸:15种
3、根据人和哺乳动物所需氨基酸是否能自身合成
必需氨基酸:Lys Val Met Try Leu Ile Thr Phe
半必需:Arg His
非必需:其余10种
不常见的氨基酸:4-羟基脯氨酸 5-羟基赖氨酸 (由常见的氨基酸经修饰而来的)
非蛋白质氨基酸:150余种;
特殊氨基酸的总结
唯一一个无手性碳、无旋光性的氨基酸 :Gly
唯一一个亚氨基酸、与茚三酮反应生成黄色物质的氨基酸:Pro
含有巯基,在空气中易氧化生成二硫键的氨基酸:Cys
在生物合成中是一种重要甲基供体的氨基酸:Met
在大多数酶的活性中心都发现有其残基的氨基酸:Ser
在生理pH条件下唯一具有缓冲能力的氨基酸:His
碱性最强、在生理条件下完全质子化的氨基酸:Arg
含有两个手性碳的氨基酸:Thr Ile
在近紫外区有吸收的氨基酸:Trp Tyr Phe
能够发生Millon反应的氨基酸:Trp
能够发生Pauly反应的氨基酸:His
能够发生坂口反应的氨基酸: Arg;(三)氨基酸的酸碱化学
aa在晶体或水中以兼性离子形式存在
等电点:在溶液某一特定pH值时,氨基酸主要以两性离子形式存在,净电荷为零,在电场中不向电场的正极或负极移动,这时的溶液pH值称为该氨基酸的等电点。
当溶液pH低于该氨基酸等电点时,氨基酸净电荷为正,反之为负。
氨基酸在等电点时溶解度最低.不同氨基酸等电点不同.
应用 根据氨基酸的电荷不同(电泳法,离子交换层析)分离混合物。
根据氨基酸的等电点不同(调节溶液pH )分离混合物。
Handerson-Hasselbalch公式
pH = pKa + lg([A-]/ [HA])= pKa + lg([碱]/[酸]) ;等电点的计算;(四)氨基酸的化学反应
1.α- 氨基参加的反应
与亚硝酸反应
与酰化试剂反应
烃基化反应
生成西佛碱的反应
脱氨基反应与转氨基反应
2,4-二硝基氟苯 (DNFB或FDNB,Sanger试剂)
苯异硫氰酸酯 (PITC, Edman试剂)
用于鉴定多肽或蛋白质的N端氨基酸及序列测定;2.α-氨基和α-羧基共同参加的反应
(1)与茚三酮的反应
(2)氨基酸的两性解离
(3)形成肽键
(4)离子交换反应
茚三酮在弱酸性溶液中与氨基酸共热,所有具有游离氨基氨基酸都生成紫色化合物(?570)。
脯氨酸和羟脯氨酸与茚三酮反应直接生成的是黄色化合物(?440)。
应用:是一个检测和定量氨基酸和蛋白质的重要反应。
用层析法把各种氨基酸分开后,利用茚三酮显色可以定性测定各种氨基酸。
;3.侧链R基参加的反应
(1)酪氨酸的酚基
米伦反应(Millon)
与HgNO3、Hg(NO3)2、HNO3作用呈红色;与浓硝酸作用生成黄色。
Pauly反应
与重氮化合物反应生成橘黄色化合物。
注: His的咪唑基与重氮化合物反应生成棕红色
(2)精氨酸的胍基
坂口反应(Sagakuchi)
与次氯酸钠(或次溴酸钠)及α-萘酚在氢氧化钠溶液中产生红色产物。;(3)Cys侧链上的巯基(-SH)
与卤化烷生成稳定的烷基衍生物------可保护 -SH 以防被氧化
Cys巯基打开氮丙啶的环
巯基能和各种金属离子形成络合物----SH 酶遇到重金属离子而生成硫醇盐时,将导致酶失活
巯基易受空气或其他氧化剂氧化-两种氧化衍生物
形成二硫化物:胱氨酸的形成
形成磺酸基:对游离的巯基具有保护作用,保护Cly巯基之间的氧化。
;二硫键的还原(打开)
①氧化剂:过甲酸(HCOOOH)
②还原剂:巯基乙醇、巯基乙酸、二硫苏糖醇等。; ;(六)氨基酸混合物的分离和分析
分配层析法的一般原理
纸层析
柱层析
离子交换层析
气液层析
薄层层析
高效(压)液相层析HPLC
;二、蛋白质通论与结构;(三)肽
一分子氨基酸的α-羧基与另一分子氨基酸α-氨基脱水缩合的化合物叫做肽.肽是氨基酸的线性聚合物。
肽键的特点
具有
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