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r8s 使用指南 中国科学院植物研究所 张金龙 编译 zhangjl@ 前 言 r8s 是美国加利福尼亚大学戴维斯分校的进化生物学家 Mike Sanderson 编写的用于 估算进化树分化时间的软件，在进化生物学、分子生物地理学等学科有着广泛的应用，已经 成为估算分化时间不可或缺的软件之一。该软件中的一些方法如 NPRS 和 PL 是软件作者最 先提出的，目前在同类的其他软件中还难以实现。R8s 的运行平台为 MacOS 和 Linux，在 国内应用的还不多，也难以找到中文的练习资料和说明。本文基于当前版本 r8s 1.7.1， 参照其说明书，介绍该软件在 Linux 下的安装和操作，并对其模块的功能和选项进行简要 的说明。 译者 于北京香山 2010 年 1 月 23 日 -I- 目 录 一 r8s 下载与安装...........................................................................................................................1 下载 ..........................................................................................................................................1 安装 ..........................................................................................................................................1 1 在 MacOS 上 .................................................................................................................