人类DNA序列TSS区域序列特征及±1核小体的位置分布.pdfVIP

????年 ??月? 内蒙 古 大 学 学 报 ?自然 科 学 版 ?? ? ??．? ????? 第 ???卷 第 ?期? ??????????????????????????????????????????????????????????? ???．??? ??．?? 文 章 编 号 ：????一 ?????????????????—??? 人 类 ??? 序 列 ???区域序 列 特 征? 及 ±?核 小 体 的位 置分 布? 杨 小希 ，李 宏 ，周德 良? ?内蒙古大学物理科学 与技术学院 ，呼和浩特 ???????? 摘 要 ：基于包含人类基因转录起始位点附近的 ???????条 ???序列，运用核小体特征量对序列? 做 分 类 分 析 ，发 现 ± ?核 小 体 位 于 ???区 域 两 侧 的 第 一 类 基 因 约 占 ??? ，???区 域 有 核 小 体? 占据 的 第 二 类 基 因约 占 ??? ．用 二 阶 信 息 冗 余 特 征 量 分 析 了 ??? 序 列 的 碱 基 关 联 分 布 ，发 现? 没 有 占据 ???区 域 的 核 小 体 对 应 的序 列 具 有 强 碱 基 关联 ，占据 ???区 域 的 核 小 体 对 应 的 序 列? 具 有 弱 碱 基 关 联 ，弱 关 联 是 ???区 域 的 普 适 特 征 ．表 明 占据 ???区域 的 核 小 体 具 有 很 强 的 序? 列 适 应 性 和 位 置 的可 变性 ．通 常 定 义 的 含 ???的 核 小 体 缺 失 区域 仅 对 第 一 类 基 因 成 立 ．推 测? 第 一 类 基 因具 有 较 高 的转 录 效 率 ．? 关 键 词 ：转录起始 区；士?核小体 ；核小体特征量 ；二阶信息冗余 ；核 小体 动态变化? 中图 分类号 ：???? 文 献标 志码 ：?? ?? 研 究 背 景? 真 核生物 的基因组 ??? 紧密缠 绕在 四种 组 蛋 白八 聚体 上 ，形 成珠 串状 的核小 体 ?????????????】?．? 每个核小体上 缠绕着 约 ?????的 ???序 列 ，相邻 核小 体之 间的 ??? 含 有组 蛋 白 ??，长 度约 为 ??～? ????，被称为连 接 ???????????????口??．这些核小 体在彼 此顶部 堆放形 成染 色质 ，在 基 因组 ???上线? 性 排列 ，并进 一步折叠 和盘绕形 成更 加 紧密 和复 杂 的染色 体．核 小体 具有 多种 功能 ，能 够协 助几英 尺 长? 的 ???折叠进 入细胞核 ，特别是可 以通过在 ??? 序列上 的定位 和移 动决定 转录 因子与转 录起 始位 点? 的接触来调 节基 因的表 达口??．转录起始 是基 因表达 调控 的关键 步骤．研究 发现 ，在转 录起始 位点 ?????—? ????????????????????，????上游和下游 的±?核小体分 布具有特殊 的模 式???：在 ???区域 两侧分别 存在 一? 个确定 的核小体位 置 ，这两个确定 的核小体 位置之 间存 在一个 明显的核小体缺 失 区域 ????，??????????? ????????????．一般认为核