高雄医学大学研发电子报.PDFVIP

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高雄医学大学研发电子报

102 年 4 月出刊 高雄醫學大學研發電子報 一、研究新知 (一)Variant of TREM2 Associated with the Risk of Alzheimer’s Disease. N Engl J Med 2013;368:107-16. TREM2 Variants in Alzheimer’s Disease. N Engl J Med 2013;368:117-27. Genetic Associations with Valvular Calcification and Aortic Stenosis. N Engl J Med 2013;368:503-12. (王姿乃教授、蔡易珊小姐摘譯) 由人類基因體計畫(Human Genome Project;HGP)揭開人類基因圖譜定序後, 為了大量研究基因的單核苷酸多型性(Single Nucleotide Polymorphism,簡 稱SNP)與疾病的關係,發展了人類全基因組關聯性研究(genome-wide association study ; GWAS),目的詴著從疾病族群與健康對照族群中找出高 風險遺傳標記的基因SNPs與疾病間關聯,並隨著全球定序的公司 如:Illumina Genome analyzer、Roche454 sequencer、Life Technologies SOLiD 等大廠發展出更快速與高通量的定序方式揭開了next-generation sequencing 之序幕,其方式從全組基因定序方式到外顯子定序(exome sequencing)更加 速了研究基因SNPs與疾病發生的關聯。自第一篇在2005年Science期刊發表 年齡與黃斑病變的GWAS,爾後在冠心病、第一、二型糖尿病、肥胖等數 百種疾病涵蓋將近一千多篇的GWAS研究,找出與疾病相關的高風險變異 基因的標記,儘管離臨床運用仍有一段路,但若能同時朝向轉譯功能 (Translation phase)發展個人化早期診斷的檢驗與治療晶片仍是主要努力的 方向。 GWAS研究法本身有其限制,必頇避免假陽性的結果而造成的假相關,且 再現性差,目前統計採用Bonferroni P值達 10?7,才具顯著意義,相對上就 相當消耗研究成本;再者大部分有變異的標記其疾病的危險勝算值(Odds ratio) 平均為1.33。統合分析法(Meta-analysis)需嚴謹地探討統整的研究中 是否存在異質性(Heterogeneity)以避免取樣誤差與刊登偏差(publication bias),而得一個整體的effect size與95% CI (confidence intervals);今年2013 至今三個月內新英格蘭雜誌已有三篇論文,透過統合分析法(Meta-analysis) 整合其他的GWAS研究結果,提供再現性的解決方式;發現 TREM2(r的變異(R47H) 2.83 (1.45–5.40)為罹患阿茲海默症的高 風險重要標記;Lipoprotein a (LPA) rOR=2.05 (95%CI, 1.63-2.57, p=9.0×10?10) 為心臟瓣膜鈣化和主動脈瓣狹窄的重要標記。 二、論文與研究分享 (一)論文 題目:A novel stacking method of repetitive large volume sample injection and sweeping MEKC for determination of androgenic steroids in urine (高雄醫學大學藥學系 吳秀梅教授提供摘要) 作者:王俊棋,

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