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生物统计上机操作第4讲卡方检验二项分布检验
研究生《生物统计学》课程 上机内容
第四讲:独立性检验与二项分布检验
独立性检验(χ2 检验)与二项分布检验:是针对离散型数据的检验,在生物科学研究中,除了分析计量资料外,还常常需要对质量性状和质量反应的次数资料进行分析,其变异情况只能用分类计数的方法加以表示,属于计数资料。
本次主要练习:
⑴ 卡方检验(独立性检验):[Analyze]=[Decriptive Statistics](描述性统计)=[Crosstabs](交叉列联表过程)
⑵ 二项分布检验:[Analyze]=[Nonparametric Tests] (非参数检验)=[Binominal](二项分布)
一、独立性检验
(一)2×2列联表独立性检验
案例:下表给出不同给药方式与给药效果,问口服与注射两种给药方式的效果差异是否显著?
给药方式有效( A )无效(?A )口服( B )5840注射(?B )3164
SPSS操作:
建立数据文件:???Variable View中定义三个变量(方式、效果、计数),其中“方式”、“效果”的变量类型定义为字符串(string)型,“计数”定义为数值(Numeric)型;在Data View中输入数据;
用Weight Cases对频数变量“计数”进行加权: [Data]=[Weight Cases],弹出对话框,选中“Weight cases by”,将“计数”导入“Frequency Variable”框中,OK
卡方分析:
[Analyze]=[Decriptive Statistics] =[Crosstabs],弹出对话框,将“方式”导入[Row(s)]中,将“效果”导入[Column(s)]中;
点击[Statistics],弹出对话框,选中[Chi-square](卡方检验),continue返回;
点击[Cells],弹出对话框,选中Counts下的[Expected](显示理论值),continue返回;
OK,运行结果输出到output窗口。
结果分析:在output中输出三个表
Case Processing Summary:检查数据缺失情况;
Crosstabulation:列联表,显示观测值(及理论值、比例、观测值与理论值的差值等)
Chi-Square Test:卡方检验结果:
Pearson Chi-Square:常用卡方检验计算的卡方值(样本数n≥40且所有理论数T≥5)
Continuity Correction:连续性矫正卡方值(df=1或n≥40但有5T≥1 )
Likelihood Ratio:对数似然比法计算的卡方值(类似Pearson Chi-Square)
Fisher’s Exact Test:确切概率法计算的卡方值(n40或T1)
(二)r×c 列联表独立性检验
案例:用A、B、C三种方法治疗仔猪白痢病,试验结果如下表,试检验不同的治疗方法是否与治疗效果有关。
治疗方法治疗效果治愈好转死亡A19165B16128C15137
SPSS操作:
建立数据文件:在Variable View中定义三个变量(治疗方法、治疗效果、计数),均定义为数值(Numeric)型。对“治疗方法”的value进行定义(“1”为“A”、“2”为“B”、“3”为“C”)、对“治疗效果”的value进行定义(“1”为“治愈”、“2”为“好转”、“3”为“死亡”),将三个变量的小数位数设为0;在Data View中输入数据;
(注:也可象上例一样,将“治疗方法”和“治疗效果”设为string型,在data view中直接输入字符串。)
用Weight Cases对频数变量“计数”进行加权: [Data]=[Weight Cases],弹出对话框,选中“Weight cases by”,将“计数”导入“Frequency Variable”框中,OK
卡方分析:
[Analyze]=[Decriptive Statistics](描述性统计)=[Crosstabs],弹出对话框,将“治疗方法”导入[Row(s)]中,将“治疗效果”导入[Column(s)]中;
点击[Statistics],弹出对话框,选中[Chi-square](卡方检验),continue返回;
点击[Cells],弹出对话框,选中Counts下的[Expected](显示理论值),continue返回;
OK,运行结果输出到output窗口。
结果分析:在output中输出三个表
Case Processing Summary:检查数据缺失情况;
Crosstabulation:列联表,显示观测值(及理论值、比例、观测值与理论值的差值等)
Chi-Sq
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