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- 2017-04-30 发布于湖北
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酶蛋白的结构
第三章 酶蛋白的结构 ;蛋白质结构和功能的关系;这种改变导致血红蛋白表面电荷减少,在脱氧状态下溶解度下降,发生不正常聚集,形成镰刀状红细胞,严重时造成红细胞破裂。血红蛋白分子共有574个氨基酸残基组成,仅仅两个β亚基上各改变了一个氨基酸残基,生理功能就发生了如此大的变化,可见蛋白质的一级结构对功能的影响之大。
;牛胰核糖核酸酶复性实验
8个Cys-SH形成4个二硫键的组合方式有7×5×3=105种,因而重新形成正确配对的概率仅1/105,
;第一节 蛋白质一级结构研究方法 ;1. 蛋白质的分离纯化和相对分子质量的测定
电泳单一带
SDS测分子量(质谱法)
;2.确定蛋白质分子中多肽链的数目
末端分析法
3. 拆分并分离蛋白质分子的多肽链
氧化法
氧化法的优点在于二硫键一旦拆开,不会重新形成连接,但在氧化过程中伴随着一些副反应,Met侧链被氧化生成亚砜,Trp侧链被破坏。
还原法
为了防止游离巯基重新氧化,还需加入烷化剂如碘乙酸,使巯基上发生取代反应而不会重新被氧化
;4. 测定每条多肽链的氨基酸组成
蛋白质完全水解:要求完全水解且不破坏氨基酸
1)酸水解:
作水解程度时间图确定最佳时间
1-10mg蛋白样品 → 加HCl → 抽真空 → 封闭 → 烘箱
特点:a)Trp完全破坏,生成不溶性物质
b)? Ser、Thr、Tyr部分破坏,Ser破坏10-15%,Thr、Tyr破坏5-10%,应予以校正
c)? Asn → Asp Glu → Gln
d)? 胱氨酸→半胱氨酸
e)? 大部分氨基酸不破坏;2)碱水解:
特点:a)Trp不破坏 b)大部分氨基酸破坏
;分离检测:1)纸层;2)薄层;3)离交;4)氨基酸自动分析仪
;5. 多肽链的N-末端和C-末端分析
目的:有几条肽链;N、C末端是何氨基酸
测不出末端的几种原因:蛋白质分子为环肽;末端被保护试剂保护;末端是Pro
5-1 N端测定(介绍原理、分离检测方法和优缺点)
1)FDNB法(Sanger法;2.4-二硝基氟苯法)
a)原理:
;b) 分离检测:乙醚萃取,DNP-Aa溶于乙醚而Aa不溶
标准Aa + DNP——反应——纸层——喷茚三酮
未知DNP-Aa-——纸层——喷茚三酮
比较即得结果,若结果是两点以上则证明是有几条肽链组成
c)优点:???应条件温和,末端产物易分离
缺点:N端是Pro测不出;不能进行N端测序
Lys的另一氨基生成e-DNP-Lys,由于它不溶于乙醚故不影响测定结果;2) 丹磺酰氯法(DNS法)
a) 原理:
;b)分离检测:DNS-Aa溶于乙酸乙酯,Aa不溶
标准Aa + DNS——反应——纸层——荧光显色
未知DNS-Aa-——纸层——荧光显色
比较即得结果,若结果是两点以上则证明是有几条肽链组成
c)优点:灵敏度高;是前种方法的100倍;用量少,样品量为0.1-2ng
缺点:DNS-Pro、DNS-Try被破坏;N端是Pro、Try测不出;不能进行N端测序 ;3) Edman降解法[苯异硫氰酸酯法(PITC法)]
a) 原理:
a)分离检测:PTH-Aa溶于乙酸乙酯、丁酸乙酯,Aa不溶
c)优点:N端是Pro可测;能进行N端测序
缺点:灵敏度稍差 ;4)DansyCl-Edman法
既可检测N端序列又有较高灵敏度 ;5) 亮氨酸氨肽酶法
此酶专一水解N端羧基形成的肽键,可测N端序列,但不能测N端为Pro.
;5-2 C-末端分析
C-末端分析方法也有很多,但至今还不能令人满意,常用的有肼解法、还原法、羧肽酶法等。
1)肼解法
原理:
;b)分离检测:
苯甲醛+酰肼→沉淀→离心
上清液中含游离基酸
2) 还原法
用还原剂如硼氢化锂处理肽链,则C-末端残基的α-羧基被还原成醇,将肽链完全水解后,分析水解产物,其中的α-氨基醇对应的即为C-末端氨基酸。
;3) 羧肽酶法
羧肽酶是一种专一从多肽链的C-末端开始逐个水解氨基酸残基的蛋白水解酶。由于该酶的专一性,当它作用于多肽链时,C-末端残基首先被水解下来,然后是C-末端第二个氨基酸残基,依此类推。根据氨基酸释放的动力学曲线,可以确定C-末端氨基酸以及靠近C-末端的几个氨基酸的排列顺序。不过这是理想的情况,实际测定中常常有多种因素干扰,很难确定C-末端多个氨基酸的排列顺序。
羧肽酶A:a)Lys、His、Arg在C-末端不能水解
b)C-末端是Pro不能水解
c)C-末端第二个是Pro,无论第一个是何氨基酸都不能水解
羧肽酶B:a)水解C-末端为Lys、His、Arg的
b)C-末端第二个是Pro,无论第一个是何氨基酸都不能水解
;6.多肽链的局部断裂和肽段的分离
在氨基酸顺序测定时,只要从
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