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限制性内
不同的限制性内切酶的最适反应温度不同。大多数是37oC,少数要求40-65oC。 酶 最适 温度oC 酶 最适 温度oC 酶 最适温度oC Apa I Bcl I Mae II Taq I 30 50 50 65 Apy I BstE II Mae III 30 60 55 Ban I Mae I Sma I 50 45 25 3. 温度 DNA分子的不同构型对限制性内切酶的活性也有很大的影响。某些限制性核酸内切酶切割超螺旋的质粒DNA所需要的酶量要比消化线性的DNA量高出很多倍。 是影响限制酶活性的重要因素。商品化的限制酶一般都带有专用缓冲液。 5. 缓冲液 化学组成 MgCl2、NaCl/KCl:提供Mg2+和离子强度 Tris-HCl:维持pH 二硫苏糖醇(DTT):保持酶稳定性 牛血清白蛋白BSA等:有助于酶的稳定 如果改变反应条件就会影响酶的专一性和切割效率,称为星号活性。 在低盐、高pH(8)时可识别和切割 GAATTA、AAATTC、GAGTTC等 GAATTC EcoR I: DNA重组 限制酶(物理)图谱绘制 突变分析(RFLP分析) 限制酶的部分酶切与完全酶切 * * 核酸内切酶分为单链DNA内切酶和双链DNA内切酶。能定点切割DNA双链的内切酶称为限制性内切酶。 限制:限制性内切酶将侵入细菌体内的外源DNA切成小片断。 修饰:细菌自身的DNA碱基被甲基化酶甲基化修饰所保护,不能被自身的限制性内切酶识别切割。 限制酶概念提出的背景: 20世纪30年代,微生物学家发现,微生物的噬菌体不能交叉感染,如E coli K株的噬菌体只能感染 E coli K株,不能感染其他株,反之亦然。这种现象称为“限制现象”。 1962年,W.Arber提出一个假设来解释上述现象。他认为这是细菌中有2种以上功能不同的酶,一 种是核内切酶,能识别并切断外来DNA分子的某些部位,使外来DNA失去活性,限制外来噬菌体的繁 殖,把这类酶称为限制性核酸内切酶。 * * I型限制性内切酶作用时需要ATP、Mg2+、SAM(5—腺苷甲硫氨酸)存在。 * 粘性末端的意义: ①连接便利 不同的DNA双链:只要粘性末端碱基互补就可以连接。这比连接两个平齐末端容易的多。 同一个DNA分子内连接:通过两个相同的粘性末端可以连接成环形分子。 ② 5’末端标记 凸出的5’末端可用DNA多核苷酸激酶进行32P标记。 凸出的3’端可以通过末端转移酶添加几个多聚核苷酸的尾巴(如AAA或TTT等)造成人工粘性末端。 ③ 补平成平齐末端 粘性末端可以用DNA聚合酶补平成平齐末端。 * 限制性片段长度多态性(restriction fragment length polymorphism,缩写RFLP)是发展最早的分子标记技术。RFLP技术的原理是检测DNA在限制性内切酶酶切后形成的特定DNA片段的大小。因此凡是可以引起酶切位点变异的突变如点突变(新产生和去除酶切位点)和一段DNA的重新组织(如插入和缺失造成酶切位点间的长度发生变化)等均可导致 RFLP的产生。 此技术及其从中发展出来的一些变型均包括以下基本步骤:DNA的提取、用限制性内切酶酶切DNA、用凝胶电泳分开DNA片段、把DNA片段转移到滤膜上、利用放射性标记的探针显示特定的DNA片段(通过Southern杂交)、分析结果。由于线粒体和叶绿体DNA较小,前三个步骤就完全可能检测出DNA片段的差异,所以往往不必要后面的几个步骤;对线粒体和叶绿体DNA进行的这种多态性差异检测在1980年之前就已出现,从理论上说,这种多态性也可称为RFLP。 限制性核酸内切酶是一类能够识别双链DNA分子
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