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设计引物前的基因序列比对和合适基因序列查找(例pigm)讲述
组内汇报;以稻瘟病pigm为例选择合适的基因序列进行引物设计;文献查找pigm的精细定位 大概70kb左右;打开网页gramene 点击blast;然后再利用gramen找到C0428得物理位置;打开blast 选rice;选则好以后 进行比对blast;查看序列;找到合适的基因序列 然后在复制有差异的一段序列 在gramene上查看物理位置是否符合要求 如不符合继续寻找;找到合适位置后点击 Sequence 出现该序列的前后250bp的碱基序列;复制序列后 用primer进行引物设计;Primer设计引物的具体过程网上很多
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