Genetic Progression and the Waiting Time to Cancer 英文参考文献.docVIP

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2017-05-11 发布于上海
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Genetic Progression and the Waiting Time to Cancer 英文参考文献

GeneticProgressionandtheWaitingTime toCancer Niko Beerenwinkel1¤*,Tibor Antal1,David Dingli1,Arne Traulsen1,Kenneth W. Kinzler2,Victor E.Velculescu2, Bert Vogelstein2,3,Martin A.Nowak1 1ProgramforEvolutionaryDynamics,HarvardUniversity,Cambridge,Massachusetts,UnitedStatesofAmerica,2LudwigCenter,SidneyKimmelComprehensiveCancer CenteratJohnsHopkins,Baltimore,Maryland,UnitedStatesofAmerica,3HowardHughesMedicalInstitute,JohnsHopkinsUniversity,Baltimore,Maryland,UnitedStatesof America Cancerresultsfromgeneticalterationsthatdisturbthenormalcooperativebehaviorofcells.Recenthigh-throughput genomicstudiesofcancer cells haveshownthat themutational landscapeofcancer is complexandthat individual cancersmayevolvethroughmutationsinasmanyas20differentcancer-associatedgenes.Weusedatapublishedby Sjo¨blometal.(2006)todevelopanewmathematicalmodelforthesomaticevolutionofcolorectalcancers.Weemploy the Wright-Fisher process for exploring the basic parameters of this evolutionary process and derive an analytical approximationfortheexpectedwaitingtimetothecancerphenotype.Ourresultshighlighttherelativeimportanceof selectionoverboththesizeofthecellpopulationatriskandthemutationrate.Themodelpredictsthattheobserved genetic diversity of cancer genomescan arise undera normal mutation rateif the average selective advantageper mutationisontheorderof1%.Increasedmutationratesduetogeneticinstabilitywouldallowevensmallerselective advantagesduringtumorigenesis.Thecomplexityofcancerprogressioncanbeunderstoodastheresultofmultiple sequentialmutations,eachofwhichhasarelativelysmallbutpositiveeffectonnetcellgrowth. Citation:BeerenwinkelN,AntalT,DingliD,TraulsenA,KinzlerKW,etal.(2007)Geneticprogressionandthewaitingtimetocancer.PLoSComputBiol3(11):e225.doi:10. 1371/journal.pcbi.0030225 mutationsmarkthehistoryofthecancercell,includingboth driversandpassengers. Introduction Thecurrentviewofcanceristhattumorigenesisisdueto theaccumulationofmutationsinoncogenes,tumorsuppres- sor genes, and genetic instabili