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Affymetrix 全基因组 SNP 芯片检测要点
Affymetrix 全基因组 SNP 芯片检测
单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP) 指基因组单个核苷酸的变异,它是最微小的变异单元,是由单个核苷酸对置换、颠换、插入或缺失所形成的变异形式。单核苷酸多态性是基因组上高密度的遗传标志,在人类基因组中已发现的SNP数量超过3000万。作为第三代遗传标记,SNP数量众多、分布密集、易于检测,因而是理想的基因分型目标。SNP分型检测在疾病基因组(如疾病易感性),药物基因组(药效、药物代谢差异和不良反应)和群体进化等研究中具有重大意义。 在人研究方面,Affymetrix 公司有分别基于GeneChip和GeneTitan平台的 SNP 6.0 芯片和针对中国人群设计的CHB1&2 Array,既可用于全基因组SNP分析,又可用于CNV分析,极大地方便了中国人类疾病GWAS研究。Affymetrix公司针对多个农业物种也开发了多款商品化的基因分型芯片,如鸡、牛、水牛、鲑鱼、水稻、小麦、辣椒、草莓???,为农业育种研究、遗传图谱构建、群体基因组学研究提供研究手段。此外,Affymetrix公司还支持定制芯片,最低起订量为480个样品。
检测原理|?技术优势|?产品列表|?定制芯片|?数据分析|
基于GeneChip平台的人SNP 6.0 芯片实验流程:
?
基于GeneTitan平台的Axiom基因分型芯片检测流程:
从SNP原理谈SNP分析技术之SNP芯片
日期:2012-05-21 ? ? 来源:网络
标签:? HYPERLINK /tags/13330/ \t _blank SNP原理? HYPERLINK /tags/13331/ \t _blank SNP分析? HYPERLINK /tags/13332/ \t _blank SNP芯片
摘要 :?SNP是近年来基因突变的热点研究之一。它是指在单个的核苷酸上发生了变异,有四种不同的变异形式,而实际上只发生转换和颠换这两种。当科学家弄清了SNP的突变原理以后,他们就着手对SNP进行分析,以求找到疾病相对应的突变位点或者是进行个性化药物治疗研究。其中应用到的技术多达上百余种,其中包括有测序技术、质谱分析技术、HRM技术、Taqman技术以及SNP芯片技术。
HYPERLINK /adtopic/2015/abmaking/ \t _blank 恩必美生物新一轮2-5折生物试剂大促销! HYPERLINK /adtopic/2015/beogene/201510.html \t _blank Ibidi细胞灌流培养系统-模拟血管血液流动状态下的细胞培养系统 HYPERLINK /zt/experiment/molecular/502814.html \t _blank 广州赛诚生物基因表达调控专题
SNP是近年来 HYPERLINK /zt/inventory/351941.html \t _blank 基因突变的热点研究之一。它是指在单个的核苷酸上发生了变异,有四种不同的变异形式,而实际上只发生转换和颠换这两种。当科学家弄清了SNP的突变原理以后,他们就着手对SNP进行分析,以求找到疾病相对应的突变位点或者是进行个性化药物治疗研究。其中应用到的技术多达上百余种,其中包括有测序技术、质谱分析技术、HRM技术、Taqman技术以及SNP HYPERLINK /zhuanti/product/201308/441234.html \t _blank 芯片技术。SNP 的分型技术可分为两个时代,一为凝胶时代,二为高通量时代。凝胶时代的主要技术和方法包括限制性酶切片段长度多态性分析(RFLP)、寡核苷酸连接分析(OLA)、等位基因特异聚合酶链反应分析(AS2PCR)、单链构象多态性分析(SSCP)、变性梯度凝胶电泳分析(DGGE),虽然这些技术与高通量时代的技术原理大致一样,但是由于它不能进行自动化,只能进行小规模的SNP分型测试,所以必然会被淘汰。高通量时代的SNP分型技术按其技术原理可分为:特异位点杂交(ASH)、特异位点引物延伸(ASPE)、单碱基延伸(SBCE)、特异位点切割(ASC)和特异位点连接(ASL)5 种方法。此外,采用特殊的质谱法和高效液相层析法也可以大规模、快速检出SNP 或进行SNP 的初筛。近年来已经在晶体上用“光刻法”实现原位合成,直接合成高密度的可控序列寡核苷酸,使DNA 芯片法显示出强大威力,对SNP 的检测可以自动化、批量化,并已在建立SNP 图谱方面投入实际应用。DNA 芯片法有望在片刻之间评价整个 HYPERLINK /zhuanti/product/201308/440993.html
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