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第二章生物信息学的生物学基础

普通生物学 细胞 遗传 进化 分子生物学 —— 研究核酸、蛋白质等生物大分子的结构、功能和相互关系 —— 研究生物大分子在生命活动中的重要性、规律性,从分子水平上真正揭开生物世界的奥秘 关于生物大分子构成的三条基本原则: (1)构成生物体各类有机大分子的单体在不同的生物中都相同; (2)生物体内一切有机大分子的构成都遵循共同的规则; (3)某一特定生物体所拥有的核酸及蛋白质分子决定了它的属性。 第一节 细胞 生命活动的基本单位 是生命存在的最基本形式,是一切生命 活动的基础。 (1)一切生物都离不开细胞这一生命的基本形态结构 (2)细胞是生命活动赖以进行的基础 代谢、生长、分裂、凋亡 生命活动建立在细胞活动的基础上 两类细胞 原核细胞:细菌、蓝细菌、原绿藻 真核细胞:如真菌 细胞的主要构成部分: 细胞膜 细胞壁 细胞核 细胞质 细胞壁 细胞质 细胞液 细胞骨架 细胞器 细胞核 真核细胞中的细胞控制中心 包含遗传信息(染色质) 与细胞质中的其它细胞器通讯 细 胞 分 裂 有丝分裂 原 核 生 物 第二节 蛋白质的结构和功能 1、蛋白质的功能 酶的催化作用 物质运载和贮存作用 营养存贮作用 运动协调作用 机械支持作用 免疫保护作用 信号接受与传导作用 生长和分化控制作用 2、蛋白质的分子组成 组成蛋白质的主要元素有: 碳(50%-55%) 氢(6%-8%) 氧(19%-24%) 氮(13%-19%)和硫 某些蛋白质还含有少量磷、铁、铜、碘、锌等 氨基酸 氨基酸(amino acid)是蛋白质的基本结构单位 对于20种标准的氨基酸,按照侧链化学性质的不同,可以分为以下三组: 极性氨基酸(容易与水分子形成氢键 ) Ser、Thr、Cys、Asn、Gln、His、Tyr、Trp 带电氨基酸 Arg、Lys(+)和Asp、Glu(-) 疏水性的氨基酸 Ala、Val、Leu、Ile、Phe、Pro和Met 甘氨酸(Gly)的侧链只有一个氢原子,是最简单的氨基酸,具有独特的性质,可以单作为第四类,也可以归于第一类。 含有芳香性侧链 Phe、Tyr、Trp、His 侧链为醇或酚的氨基酸有 Ser、Thr、Tyr 可以形成氢键 Arg、Lys、Asp、Glu、Ser、Thr、Asn、Gln、His、Tyr及Trp 3、蛋白质的结构层次 (1)蛋白质的一级结构 (primary structure) 蛋白质的一级结构是指多肽链中氨基酸的序列 肽键的形成 H H O H H O ? ? ?? ? ? ?? —N—C—C— —N—C—C— ? ? CH2 CH2 ? ? SH S 半胱氨酸 ? SH S ? ? CH2 CH2 ? ? —N—C—C— —N—C—C— ? ? ?? ? ? ?? H H O H H O

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