生工09微生物遗传-5-转座因子.pptVIP

6、微生物中的转座因子 主要内容 6.1 转座子概述 6.2 细菌转座子的类型和结构 6.3 细菌转座子的遗传效应和应用 6.1 转座子概述 6.1.1 概念 转座因子（transposable element, TE）是细胞中能改变自身座位的一段DNA序列，它可以从复制子的一个座位跳跃到另一个座位，已从同一个细胞的一个复制子跳跃到另一个复制子，DNA片断的这种运动称为转座。 这段会跳跃的DNA片断称为转座子 。 第一个转座因子是美国遗传学家McClintock于20世纪50年代通过对玉米的遗传研究中发现的，现在认为转座子存在于地球上所有的生物。转座子学说使McClintock荣获1983年诺贝尔生理医学奖。 6.1.2 转座子的特点 是基因组内相对独立的、可移动序列。它们不必借用噬菌体或质粒的形式就可以从基因组的一个部位直接转移到另一个部位。 转座子每次移动时携带着转座必需的基因一起在基因组内跃迁，所以转座子又称跳跃基因（jumping gene）。 转座子是基因组的正常组成成分，不以独立的形式存在（如噬菌体或质粒DNA）。 转座的发生不依赖于转座子和靶位点之间任何的序列同源性。 转座以很低的频率发生（睡美人），而且转座子的插入是随机的. 6.1.3 转座子的分类 两个基本类型： DNA转座子：一种是以编码蛋白质的DNA序列的形式存在，其编码的蛋白能直接操作DNA，从而使转座子能够在基因组内繁殖其自身。 RNA作为中介：与反转录病毒有关，并且它们可移动的特性来自于它们能由RNA转录物产生DNA拷贝，这种DNA拷贝然后被整合到基因组的新位点。 6.2 细菌转座子 细菌中可转座的遗传因子可分为四类 插入序列 转座子 接合型转座子 某些温和性噬菌体 6.2.1 插入序列 最简单的转座子，被称为插入序列IS（insertion sequences, IS）。IS元件是细菌染色体和质粒的正常组成部分，表示法一般按照发现的顺序或发现人的意愿，用阿拉伯数字表示，如IS1, IS2等。 IS元件是独立的结构单位，每个元件只编码为自身转座所需要的蛋白质。 IS结构 IS元件具有一个典型的结构，它的末端为反向重复序列，而与其相连的宿主DNA的末端为短的正向重复序列。 在插入部位，IS DNA总是和很短的正向重复序列（direct repeats）相连。但在插入之前靶部位只有这两个重复序列中的一个。转座后在转座子的两侧各存在一个此序列的拷贝。 转座的结果是靶部位序列形成了两个正向重复序列。 当在一段DNA序列中见到这种结构类型时，可被用来鉴别转座子。 反向重复序列标明了转座子的末端。所有类型转座子的转座皆需转座酶（transposase）对末端的识别。 所有的IS元件皆含有一个单一的长编码区，其起始于一端的反向重复序列之内，而刚好终止于另一端的反向重复序列之前或之内，它编码转座酶。 6.2.2 细菌转座子(Tn) 将带有抗性基因并能在不同DNA分子间移动的遗传单位叫做细菌转座子（bacterial transposon, Tn） 一般带有抗性基因，容易被鉴定，所以研究得较为深入 Tn还带有其它基因，如乳糖发酵基因、胞外肠毒素基因等 6.2.3 细菌转座子的分类 复合转座子 有两个完全相同或类似的插入序列（IS）和某种抗药性基因组成的复合因子 两个IS在Tn中做反向或正向排列，IS可单独转座，也可带动整个Tn转座。 复杂转座子（TnA转座子） 长度约5000bp，两端是长度30-40bp的末端反向重复序列（IR），或正向重复序列（DR），中央是转座酶基因和抗药性基因。 总是作为一个整体单位进行转座。 6.2.4 细菌转座因子的插入机制 转座子插入到一个新的部位的通常步骤是：在靶DNA上制造一个交错的切口，然后转座子与突出的单链末端相连接，并填充切口。 交错末端的产生和填充解释了在插入部位产生靶DNA正向重复的原因。链的切口之间的交错决定了正向重复的长度。 6.2.5 三种不同类型的转座 复制型转座（replicative transposition）：作为自身移动的一个部分，转座子被复制，一个拷贝仍然保留在原来的位置上，而另一个则插入到一个新的部位，这样转座过程伴随着转座子拷贝数的增加。 剪-贴型转座（非复制） 转座元件作为一个物理实体直接由一个部位转移到另一个部位。 保守型转座（非复制） 保守型转座是另一种非复制型的转座过程，该过程中转座元件从供体部位被切除并通过一系列的过程插入到靶部位，在该过程中每个核苷键皆被保留。 该转座过程与λ的整合机制类似，并且转座酶与λ整合酶家族有关。 保守型转座 6.2.6 反转座子和反转录病毒 转座元件或转座子是基因组中可移动的独立的DNA序列 从DNA到DNA的转移过程称为转座 从DNA到RNA再到DN