附件3_α-SYN相关蛋白质的生物信息学数据分析.doc

补充材料三（Supplementary data 3） α-SYN相关蛋白质的生物信息学数据分析 An analysis of bioinformatics datasets related to α-SYN associated proteins i．14-3-3ε，或酪氨酸3-单加氧酶激活蛋白质，是14-3-3蛋白质家族成员在脑内的主要存在形式．14-3-3ε与α-SYN之间存在同源氨基酸序列的百分比是40%，前者是MAPKs异构体细胞外信号调控激酶-2（extracellular signal-regulated kinase 2，ERK2）激活剂[1, 2]，后者是ERK2抑制剂[3]，它们在酶磷酸化修饰及其活性调控过程中显示相互拮抗的生物学效应[1]. ii．TH，或酪氨酸3-单加氧酶，是DA等儿茶酚胺神经递质合成的限速酶，在Ser-19、Ser-31和Ser-40等磷酸化位点被ERK2等蛋白质激酶修饰后获得酶促催化功能[1]．在DA合成过程中，α-SYN负性调控TH酶活力． iii．ERK2，或MAPKs-1，是蛋白质磷酸化三级酶促级联反应第三级酶，在细胞膜穴样内陷小凹协同小窝蛋白质（caveolin-1，Cav-1）共同组装信号分子[4]．ERK2在N端68～133氨基酸序列形成蛋白质结合结构域，借此与α-SYN发生作用[5]．α-SYN除直接地抑制ERK酶活力之外，尚通过调控Cav-1表达量间接地抑制ERK酶活力[4]． iv．MAPKs异构体p38（P38），或MAPKs-11或MAPKs-12或MAPKs-13或MAPKs-14，在N端68～134氨基酸序列形成蛋白质结合结构域，借此与α-SYN发生作用[5]．P38与ERK2互为MAPKs异构体． v．DAT，或DA活化转运体（DA active transporter），是囊泡单胺转运体蛋白质（vesicle monoamine transporters，MAPs）异构体，在C末端形成蛋白质结合结构域，借此与α-SYN的NAC发生作用[6]．α-SYN作为DAT抑制剂参与DA释放和再摄取[6]． vi．VMAT2，或突触囊泡胺转运体（synaptic vesicle amine transporter），是MAPs异构体．VMAT2 与α-SYN的作用方式类似于DAT与α-SYN的作用方式，但是VMAT2受α-SYN的影响程度弱于DAT受α-SYN的影响程度[6]．α-SYN作为VMAT2抑制剂参与DA贮存． vii．Aβ是I-型跨膜蛋白质淀粉样前体蛋白质（beta amyloid precursor protein，APP）连续经过β-分泌酶和γ-分泌酶酶解α-SYN通过NAC与Aβ形成分子间交联物[8]．此外，α-SYN在N端1～56氨基酸序列（特别是N端25～35氨基酸序列）形成蛋白质结合结构域，借此与Aβ发生作用． viii．α-Syn亲和蛋白质-1（synphilin-1，Sph1），或α-SYN相互作用蛋白质（α-SYN interacting protein），是锚定于突触囊泡锚蛋白oiled coil domain），前者是神经递质囊泡α-SYN在N端1～39氨基酸序列形成蛋白质结合结构域，借此与Sph1发生作用[10]． ix．MAP-1B是由一个高分子量亚基（称为重链）和几个低分子量亚基（称为轻链）组成的复合蛋白质[11]．MAP-1B重链和任一轻链均具有蛋白质结合结构域，借此与α-SYN的C端109～140氨基酸序列发生作用[11]． x．微管相关蛋白质-τ（MAP tau，Tau）是MAP-2基因转录物和（或）Tau基因转录物被剪切之后产生的选择性异构体 [12]．Tau在C末端氨基酸序列形成蛋白质结合结构域，借此与α-SYN的C端87～140氨基酸序列发生作用[12]． xi．α-Tub是微管蛋白质异二聚体亚基-1，在C末端10个氨基酸序列形成蛋白质结合结构域[13，14]，借此与α-SYN的C端60～100氨基酸序列发生作用[15]． xii．β-Tub是微管蛋白质异二聚体亚基-2．在C末端18个氨基酸序列形成蛋白质结合结构域[13，14]，借此与α-SYN的C端60～100氨基酸序列发生作用[15]． xiii．Ub，或热休克蛋白质-8（8-kDa heat shock protein），是介导Ub依赖性蛋白质与蛋白质相互作用的信号分子[16]．蛋白质泛素化依次通过硫酯化反应（泛素化反应第一步）、转硫酯化反应（泛素化反应第二步）和非酶促缩聚反应（泛素化反应第三步）将Ub和α-SYN缩合为Ub-α-SYN加合物，Ub与α-SYN之间最终以异肽键相连接[17]． xiv．Ub结合蛋白质p62（Ub binding protei