生物无机化学第二章重要的生物配体.pptVIP

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生物无机化学第二章重要的生物配体

第一节 氨基酸 第二节 蛋白质 第三节 金属离子与氨基酸和蛋白质的相互作用 第四节 核酸 第六节 酶 第七节 金属离子与酶的配合物 导语 生物无机化学的主体部分: 由金属元素的配位化合物所构成。 在生命体系中: 金属中心常常被给电子的各种配体所“包围”。 生物体系中的配体可分为两类: 1. 简单的无机小分子或阴离子: 例如:H2O、S2-、O2-、OH-、PO43-、Cl-、HCO3-等; 2. 生物大分子: 例如:蛋白质(或多肽)和核酸。 第一节 氨基酸 氨基酸:是蛋白质的基本结构单元。 已发现:自然界中存在的氨基酸有100多种,但参与组成蛋白质的氨基酸却只有20种,称为必需氨基酸。 第一节 氨基酸 常见α-氨基酸名称,中英文简称和结构式。 P13-14 20种,组氨酸、半胱氨酸、谷氨酸(☆) 说明 α-氨基酸多数是二齿,但有例外。 侧链上也有可配位基团,例如组氨酸中侧链上咪唑基也会参与配位。 另外还有蛋白质,应考虑多种因素,例如pH。 举例:组氨酸 ——pH=4-11, Zn(His)2六配位,八面体 ∴组氨酸为三齿(pH=8,几种配合物都存,主是上) 而pH<4 ,Zn(His)2四配位 (∵pH低,咪唑N质子化,失去配位能力) 第二节 蛋白质 蛋白质分子中氨基酸连接的基本方式是肽键。 两个氨基酸分子之间失去一个水分子而形成一个肽键。 任何数目的氨基酸都能以这种方式连接成多肽链。 蛋白质结构多样性的原因: 组成氨基酸种类不同; 每种氨基酸的数目成百上千; 氨基酸形成肽链时,不同种类氨基酸的排列顺序千变万化; 肽链的盘曲、折叠方式及其形成的空间结构千差万别 说明 肽——人工接肽反应,α-氨基酸碳末端与另一氮末端缩合失水而成,用缩合剂例如N,N`-二环己基碳二亚胺和水反应生成N,N`-二环己基脲 肽键与酰胺基有何区别? 短;部分双键;不能自由旋转 维持蛋白质作用力——二硫键;疏水键 第三节 金属离子与氨基酸和蛋白质的相互作用 蛋白质与金属离子的配位与氨基酸明显不同。 金属离子和蛋白质组成配合物后,金属可影响蛋白质的电子结构和反应能力,并对蛋白质的结构起稳定作用。 大多数金属离子与蛋白质的结合可分为两类: 一类:是金属和蛋白质牢固地结合在一起,金属离子是蛋白质的组成部分,将金属离子移去后,金属蛋白的活性也就失去。在这一类金属蛋白中,金属与蛋白质之比为一恒定常数,金属与蛋白质组成一个稳定的配合物。 另一类:是金属和蛋白质结合较弱,金属容易被除去,且金属和蛋白质之比不恒定。 说明 肽的金属配合物 肽可配位基团(5种) 多肽与蛋白质区别——蛋白质:具有高级结构的多肽;寡肽与肽类似 但蛋白质在一定条件下,∵金属满足条件—— ①配体具有强配位能力②处于有利配位位置 ∴蛋白质配合物并不多 牛胰岛素A链21,B链30个残基,属于二聚体,通有2个二硫键连起→蛋白质结构复杂需用晶体分析 第四节 核酸 脱氧核糖核酸(DNA)是染色体的主要成分,真核生物的线粒体和叶绿体中也含有DNA,原核生物的质粒全由DNA构成。 除了RNA病毒和噬菌体外,DNA是所有生物的遗传物质基础。生物体的遗传信息都储存在DNA分子中。 碱基结构:某个N可配位,某N某C(嘌呤N-1,N-7,C-8; 嘧啶N-3可配位) 碱基位于外侧(Z-DNA)或内侧(B-DNA) DNA结构:骨架:磷酸+核糖;内侧:碱基;两键-反向-右旋(氢键维持双旋) 例如:八面体多吡啶钌配合物,φ=10nm,比碱基间距(0.34nm)大,不可完全插入 双螺旋间作用力:碱基堆积力(πe作用);碱基氢键;残基上电荷静电作用 1953年,沃特森和克里克提出了DNA的双螺旋模型: DNA由两条方向相反的多核苷酸链所构成;脱氧核糖和磷酸二酯键所形成的骨架在外侧,两两配对的碱基在双螺旋内侧;每对碱基处于同一平面,和中心轴垂直,而不同碱基对的平面互相平行。 第六节 酶 酶是一类由活细胞产生,具有催化活性和高度专一性的特殊蛋白质。 由于酶的本质是蛋白质,因此酶主要由氨基酸构成。 酶一般分为六大类: 1、氧化还原酶类,催化氧化还原反应; 2、转移酶类,催化功能基团转移反应; 3、水解酶类,催化水解反应; 4、裂解酶类,催化从底物移去一个基团; 5、异构酶,催化异构体互相转变; 6、合成酶,催化双分子合成一种新物质。 酶的催化特性: 1、高效性; 2、高度专一性; 3、反应条件温和; 第七节 金属离子与酶的配合物 酶——Pr生物催化剂 例如:碳酸酐酶是金属酶,以Zn2+做辅基,促CO2+H2O=HCO3-,到肺再进行逆向反应呼出CO2, 其酶变率10-6s-1。1mol酶每秒能催化底物的mol数即1

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